第六章生物信息学初步第二节2010.pptVIP

* * 对核酸的分析是生物信息学的基础功能。 蛋白序列的同源比较要比DNA序列的同源比较敏感2~5倍 下面是一些具体的应用。 * 对核酸的分析是生物信息学的基础功能。 蛋白序列的同源比较要比DNA序列的同源比较敏感2~5倍 下面是一些具体的应用。 * 对核酸的分析是生物信息学的基础功能。 蛋白序列的同源比较要比DNA序列的同源比较敏感2~5倍 下面是一些具体的应用。 基因结构分析 6. 基因上游调控区分析 　　对转录因子数据库TRANSFAC、PlantCare、Place进行搜索，寻找可能的转录因子结合位点。 　　方法：输入起始密码子上游序列。结果将给出很多可能的转录因子结合位点，注意选择其中分值较高的位点。 7. 重复序列分析 　对核酸序列中的重复序列进行分析，查找可能的SSR位点。 　方法：利用SSRhunter软件分析。 二、蛋白质序列分析和结构预测 1.跨膜区预测?? ? 由于膜蛋白不溶于水，分离纯化困难，不容易生长晶体，很难确定其结构。因此，对膜蛋白的跨膜螺旋进行预测是生物信息学的重要应用。 ? ? 推荐使用TMHMM软件（http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/）对蛋白进行跨膜预测。　方法：输入待分析的蛋白序列即可。  ?? ? 2. 信号肽预测? ? 信号肽位于分泌蛋白的N端，