采用基于高分辨率熔解曲线技术的SNP标记定位徐州142无絮的短绒控制基因.pdfVIP

cottonscience 棉花学报 2017，29(1)：l一8 采用基于高分辨率熔解曲线技术的SNP标记定位 徐州142无絮的短绒控制基因 吴春珲，马启峰，李海晶，王文魁，裴文锋，李兴丽，吴嫂，张金发，于霁雯+，喻树迅’ (中国农业科学院棉花研究所／棉花生物学国家重点实验室，河南安阳455000) L)徐州142(xzl42)×xzl42w的F2群体为研究对象，利用108个简单重复序列(simplesequencerepeat，ssR) nucleotide 标记对n2进行初步定位，再根据2个亲本材料中有单核苷酸多态性(singlepolymorphic，sNP)的差 异基因设计50对sNP引物，用高分辨率熔解曲线(Hi曲resolutionmelting，HRM)技术从中筛选在亲本间有多 态性的sNP引物，并用于后代的基因分型。【结果】利用108个ssR标记将n2初步定位在26号染色体的20．2 cM的遗传区间内；用HRM技术筛选到9对亲本间有多态性的sNP引物，成功实现基因分型；并结合以ssR 构建的连锁图谱，将n2的遗传区间缩小为19．5cM，力：与最近的SNP标记Cricaas20158遗传距离为5．5cM，且 遗传图谱上的标记与四倍体陆地棉测序物理图谱基本一致。【结论】HRM技术可用于棉花中的sNP检测和n2 基因的定位。 关键词：陆地棉；高分辨率熔解曲线；单核苷酸多态性；简单重复序列；棉纤维；基因定位 中图分类号：s562．03文献标志码：A DOI：10．11963／issn．1002—7807．201701001 文章编号：1002—7807(2017)0l一0001—08 Genetic ofaFuzzlessMutantGenein Cotton Mapping Upland (Gossypfu，71，1，，．Sufum ResoIution NucIeotide Markers L．)UsingHigh MeIting—BasedSingIe PoIymorphism Wu Ji． Chunhui，MaQifeng，LiHaijing，wangWelll(ui，PeiWenfeng，Lixin鲥，WuMan，zhangJinfa，Yu wen+．YuShuxun+ ofConon of C酣on Research，Chinese (1nstitute AcademyA伊iculml矧sciences／s诅teKeyhborato巧ofBiology，Anyang， Hena玎455000，Cjl如a1 aimedto themzzless inxzl42wcotton Abs乜act：[0bjectiVe】Thisstudy map mutant(i．e．，nakedseed)genen2 plants．[Method] An f而macrossbetweenxzl42andthelintless一如zzless F2 L．)was populationofuplandcotton(Gos置，pfU埘矗打_summgenemted f