第8章基因表达与调控下-1.pptVIP

1．反式作用因子的DNA结合结构域（DNA binding domain)中的几种常见基序： 1）螺旋-转折-螺旋（Helix-turn-helix,HTH）基序 结构：两段螺旋被一短的转角结构分开，其中一段螺旋为DNA识别螺旋． 与DNA结合方式：第一、二个螺旋靠外侧，第三个螺旋则与DNA大沟相结合，并通过其N端的多余臂与DNA的小沟相结合。 2）锌指(Zinc finger)基序 锌指家族可分为：锌指、锌纽、锌簇 结构： (His2／Cys2)或 (cys2／cys2)与一个锌离子形成配位键，这些氨基酸对之间的多肽链成环状突出并折迭成指形结构，多个锌指结构常串联重复。 与DNA结合：锌指族转录因子以二聚体形式同DNA上的顺式调控元件结合。如类固醇受体家族：两个锌原子将两个α螺旋装配成类似H-T-H结构，再以同源二聚体的方式将两个α螺旋结合在相邻的大沟中。 含锌指基序的转录因子：与GC盒结合的SPl、类固醇激素受体家族，抑癌蛋白WT1等。 3）碱性-亮氨酸拉链(basic-leucine-zipper)基序 结构：由一段每隔6个aa 就有一个Leu的伸展肽链组成，这些周期性出现的Leu都位于α—螺旋的同—侧面，因此两条均含Leu拉链基序的蛋白质通过亮氨酸侧链的相互作用形成二聚体。 与DNA的结合：通过氨基端的20-30个碱性氨基酸与DNA结合，二聚体的形成增强了其结合力。 具有亮氨酸拉链基序的转录因子：原癌基因C-Jun/C-fos(APl家族) 4）碱性-螺旋-环-螺旋(basic-helix-loop-helix，bHLH) 结构：由2个α螺旋间隔一个非螺旋的环(loop)组成． 与DNA的结合：通过氨基端的碱性区在形成同源二聚体的情况下与DNA结合。 具有bHLH的转录因子：如原癌基因产物C-myc及其结合蛋白Max． Helix-Loop-Helix motif: 含HLH和Leu-拉链基序的转录因子的相似性： ①均至少含有一个α螺旋，其中都有一侧亲水面和一侧疏水面，因此这两种基序又称为两亲α-螺旋基序． ②两类转录因子均依靠α螺旋氨基端附近的碱性区（带正电荷aa区）与DNA结合，因此又分别称为bzip和bHLH （b=basic，碱性) ③两类转录因子活性都依赖于二聚体化 5）同源域蛋白 同源域：指编码60个保守氨基酸序列的DNA片段。 酵母GCN4、GAL4、MAT?2，哺乳动物Oct-2、Oct-1、Pit-1及线虫的Unc-86等属于同一族同源盒蛋白质－Antp，与果蝇体节发育同源盒结构域具有同源性。 同源异形蛋白结构: 含保守的N端(MSSLYYXN)-可变区(富含ASGPD)-N端同源盒肽(IYPWMC)-同源盒结构域(2、3螺旋为HTH结构)-偏酸性C端。 同源异形基因均有一同源异形盒顺序，长约180核苷酸编码60个氨基酸，含四个α螺旋，第2、3螺旋形成HTH基序结合到DNA的八聚体顺序(octamer sequence)由第3螺旋插入DNA大沟。 同源转换区蛋白之所以具有转录调节功能，与这些蛋白C末端类似于原核基因阻遏物螺旋-转角-螺旋结构有关。 2、转录活化结构域 反式激活结构域(Transactivation domain) 是反式作用因子的转录调控结构域，一般由DNA结合结构域外的30-100个aa组成． 1）带负电荷的螺旋结构域: 酸性氨基酸高度集中，如GAL4、GCN4、AP1/Jun； 2）富含谷氨酰胺结构域: 在Sp-11、Oct-1、Oct-2、HAP-1、HAP-2、GAL11、Jun、Ap-2、SRF等转录因子中发现，Sp-1结合GC box，活化结构域含25%谷氨酰胺； 3）富含脯氨酸结构域: CTF/NF-1、AP2的C端出现，含20-30%脯氨酸，Jun、 Oct-2等亦出现 3、反式作用因子家族 同一类序列特异性转录因子一般由基因家族编码，它们的蛋白结构同源，并结合特异的顺式调控元件 1）POU家族 这一家族中都有一个独特的DNA结合结构域-POU结构域 POU结构域包括： N端POU特异结构域(POUs)+C端POU同源异形结构域(POUH）． POU结构域是Pit1，octl／oct2和unc86等反式作用因子共有的保守区，因此这类蛋白统称为POU结构域蛋白。 2）类固醇激素受体家族 包括：糖皮质激素受体(GR），性激素受体(ER／AR)，甲状素激素受体 (TR)，维甲酸受体(RAR)，VitD3受体(VD3R)． 这些受体位于胞质或核内，通过激活基因转录起作用．这些受体的DNA结合结构域都含有2个Cys2／Cys2型锌指基序