案例分享_序列与双硫键共同影响下的蛋白质热力学转变问题.PDFVIP

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2017-05-26 发布于湖北
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案例分享_序列与双硫键共同影响下的蛋白质热力学转变问题

序列与双硫键共同影响下的蛋白质热力学转变问题理学院化学系何学浩教授课题组杜波蛋白质的热力学转变问题课题背景蛋白质的功能由其独特的结构决定，对蛋白质热力学转变的热力学研究有助于人们理解其结构与功能之间关系，更能够为设计特殊功能的蛋白质提供理论指导。本课题主要研究简化的蛋白质模型，该模型可以重现出蛋白质热力学转变的一般规律。研究内容蛋白质聚集态结构热力学转变与其序列的依赖关系蛋白质中双硫键对热力学转变的影响研究方法 Wang-Landau并行抽样法 Wang and Landau, Physical Review Letters. 2001. 计算任务执行概况并行抽样测试条件 OpenMP共享内存架构体系大小天津大学超算中心课题组集群 24线程 8线程单线程 8线程单线程 24 线程12 GB 内存 N=90 2.2GHz 2.2GHz 2.2GHz 2.0GHz 2.0GHz 最小耗时：5 hr 样本量：24种序列加速比与核数以及频率成正比使用总结加速效果十分明显提高计算任务执行效率显著促进科研进程