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4、细菌的生态条件 第一节 细菌的分类与鉴定 二、细菌分类鉴定的依据和方法 (一)经典方法(依据细菌形态、细胞结构、生理生化特性) 温度 pH O2 等 不同微生物对生态条件的需求有差异,这种差异也是分类鉴定的重要依据。 第一节 细菌的分类与鉴定 二、细菌分类鉴定的依据和方法 (二)细菌的数值分类法(始于20世纪50年代末 ) 数值分类法与传统方法的区别: 采用更多的分类特征,并且各特征不分主次,同等对待。 用数理统计的方法处理细菌的各种特征,求出相似值,根据相似值大小决定细菌在分类学中的关系,并进行类群的划分。 第一节 细菌的分类与鉴定 二、细菌分类鉴定的依据和方法 (三)分子分类法 分类的依据:遗传特征 1、G+C百分比的测定 原 理: G+C G+C+A+T ×100% G+C百分比值= A-腺嘌呤 T-胸腺嘧啶 G-鸟嘌呤 C-胞嘧啶 (2)不同细菌G+C百分比值的变化幅度较大(27-75%) (1)同种细菌DNA中的碱基对的顺序、数量和比例稳定。 2、核酸杂交 第一节 细菌的分类与鉴定 二、细菌分类鉴定的依据和方法 (三)分子分类法 基本原理: 双链DNA加热解链成为单链; 恢复温度后DNA单链互补形成稳定的双链 3、16S rRNA碱基测序(80%的rRNA) 原 理:根据不同原核生物16S rRNA碱基序列的相似性比较不同生物间的进化关系。 第一节 细菌的分类与鉴定 二、细菌分类鉴定的依据和方法 (三)分子分类法 微生物分类方法 经典方法 数值分类方法 分子分类方法 个体形态观察 群体形态观察 各项理化指标采用“等重原则” G+C含量的测定 核酸杂交 16S rDNA序列的测定 形状 (球,杆,螺旋) 大小 (微米) 染色等 菌落:颜色,边缘,隆起度,粘度等 菌苔 形态学 形态学 生理生化测定 (碳源、氮源利用等) 第一节 细菌的分类与鉴定 三、生物的分类系统 (一)两个生物分类系统 1、生物的五界系统: 惠特克,1969年; 动物界 植物界 原生生物界 真菌界 原核生物界 2、三原界(三域)系统:沃斯,1978 根据生物的16SrRNA碱基序列,对生物进行划分。 真细菌 古细菌 真核生物 第一节 细菌的分类与鉴定 三、生物的分类系统 (一)两个生物分类系统 影响较大的两部著作: 第一节 细菌的分类与鉴定 三、生物的分类系统 (二)细菌的分类系统 1、《伯杰氏细菌鉴定手册》,1994年,第九版 特点:吸纳了与核糖体RNA测序有关概念,并结合常规分类信息。 特点:以细菌形态、生理类型为依据,参考了系统发育关系 2、《伯杰氏系统细菌学手册》,第2版已出版 第二节 真细菌 1、革兰氏阴性菌 2、革兰氏阳性菌 3、放线菌 真细菌是人类研究得最多的一类原核生物。 螺旋体 球菌 杆菌 螺菌 需氧 兼性 厌氧 球菌 乳酸菌 杆菌(有芽孢、无芽孢) 假丝状杆菌 按形态及与氧的关系分 第二节 真细菌 一、革兰氏阴性菌 (一)需氧性杆菌和球菌 (二)需氧性螺菌和弯曲杆菌 如:克雷伯氏杆菌、布氏杆菌、假单胞菌属的成员。 哈维氏壶菌 (三)兼性厌氧细菌 按形态、鞭毛及氧化酶反应分 肠杆菌科 弧菌科 巴斯德氏菌科 沙门氏菌属 志贺氏菌属 大肠杆菌属 动物肠道的病原菌 饮水卫生标准的指标菌 分子遗传学研究的生物材料 第二节 真细菌 一、革兰氏阴性菌 第二节 真细菌 一、革兰氏阴性菌 (四)蓝细菌 形状:球状、杆状,单细胞或多细胞连接的丝状。 大小:直径范围,0.5—60μm, 大多3-10μm。 1、形态大小: 链杆状 丝状聚合体 球状(正在分裂) 第二节 真细菌 一、革兰氏阴性菌 1、形态大小: (四)蓝细菌 (1) 进行放氧光合作用(有氧条件下) 3、蓝细菌的主要生理特点 第二节 真细菌 一、革兰氏阴性菌 (2)部分具有固N能力(热带地区、水稻田) 异形胞 (四)蓝细菌 第二节 真细菌 二、革兰氏阳性菌 (三)革兰氏阳性杆菌 芽孢杆菌:芽孢杆菌属和梭菌属 无芽孢杆菌 需氧、兼性厌氧菌 专性厌氧菌 (一)革兰氏阳性球菌 子细胞聚集排列状态、呼吸类型。如:枯草芽孢杆菌。 (二)乳酸细菌 代谢特征:发酵产物为乳酸 大肠杆菌 (Escherichia coli,常常简写为:E. coli ) 革兰氏阴性菌: 革兰氏阳性菌: 枯草芽孢杆菌 (Bacillus subtilis,简写:B. subtilis); 金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aur
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