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基于神经网络技术自动筛选抑制剂的算法研究-模式识别国家重点实验室.PDF

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基于神经网络技术自动筛选抑制剂的算法研究-模式识别国家重点实验室

南京大学学报(自然科学) 第45卷第1期 V01.45,No.1 OF UNIVERSITY JOURNALNANJING 2009年1月 Jan.,2009 (NATURALSCIENCES) 基于神经网络技术自动筛选 Monastrol 抑制剂的算法研究 胡 艺h2,章 东-,∥,张 菇1’2,葛 云2,周晓波3 (1.模式识别国家重点实验室,中国科学院自动化研究所。北京,100080; 2.南京大学声学研究所,电子科学与工程系,南京,210093; for 3.HarvardCenterfor and Bioinformatics, NeurodegenerationRepair-Center HarvardMedicalSchool,1249 02215,USA) Boylston,Boston,MA content 摘要:带自动荧光最微镜的HCS(highscreening)系统是一种新兴的显微摄影、筛选和处理 系统.HCS系统在摄影过程中会产生大量数据,人T筛选和识别费时费力.本文为了进行Monastrol抑 制剂的筛选,基于前馈式神经网络技术研究了一种对HCS系统摄影的大量细胞同时进行特征提取和细 胞显型识别的自动算法.在得到各个通道分离的图像后,对不同通道图像进行并行预处理,并采用神经 网络和逻辑运算相结合的算法进行处理.我们将该方法运用于Monastrol抑制剂的筛选中,并将结果与 mitotic 人工识别结果进行分析比较.相比较前人提出的multi—phenotypicanalysis(MMA)算法自动识 别的正确率得以提高,可更好评估抗癌药剂效用. 关键词: 高容量分析,高容量筛选,图像分析,神经网络。模式识别 中图分类号: TP391.41 Classificationbasedonneuralnetworkfor content approach high analysis inMonastrol screens suppressor Hu Yun Xiao—B03 Zhel”,Ge2,Zhou Yil”,ZhangDon91”,Zhang (1.National ofPattern Laboratory Recognition。Beijing,100080,China; 2.InstituteofAcoustics.NanjingUniversity。Nanjing,210093,China; 3.HarvardCenterfor and forBioinformatics,

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