乙型肝炎病毒X基因区序列的系统发育树分析_0.docVIP

乙型肝炎病毒X基因区序列的系统发育树分析 作者：张豪，孙桂菊，钱耕荪，屠红 ［摘要］目的: 研究 利用乙型肝炎病毒X基因区序列构建系统发育树进行基因型 分析 的可靠性。 方法 : 从美国NCBI基因库中下载HBV全基因序列共249条，其中166条为已知基因型的序列，83条为未知型序列。利用ClustalX1.8软件和TreeView软件对已知基因型的X区序列构建进化树图，分析由该方法获得的基因型是否与原来的吻合，并对未知型序列进行基因型分析，再用S区的进化树分析加以验证。 结果: 已明确基因型的166条序列利用X基因区序列分析得到的基因型与原先的基因型完全吻合。用X区和S区序列分析方法对83条未知型序列分析的结果是一致的，分别获得A型16条、B型17条、C型27条、D型21条及F型2条，未发现E、G和H型。 结论: 利用乙型肝炎病毒X基因区序列进行基因型分析是完全可靠的，有助于HBV的致病机制研究。 　　［关键词］ 乙型肝炎病毒;基因型;系统发育树;X基因 　　乙型肝炎病毒（HBV）属于嗜肝DNA病毒科，具有双链DNA分子结构，全长大约3.2kb。由于HBV以mRNA为中间体进行逆转录复制，复制过程缺乏校对酶的作用容易发生碱基配对错误，导致HBV基因突变十分频繁。虽然HBV的血清型分型已建立多年，但不能深刻反映HBV病毒的变异，其临床上意义也不大。HBV基因型分