基干钾离子通道开放中药降压成分发现探讨.docVIP

基于钾离子通道开放的中药降压成分发现研究 　　[摘要]该文以降压靶标膜ATP敏感钾通道（ATP-sensitive potassium channel，K AT。）为研究对象，构建其基于配体和基于受体结构的药效团模型，并分别筛选中药化学成分数据库（traditional Chinese medicine database，TCMD），利用分子对接评价筛选结果，发现具有潜在KATP开放作用的中药降压活性成分。其中，基于配体的药效团模型（ligand based pharmacophore，LBP）以对人源KATP具有开放活性的48个化合物为研究对象，利用Hypogen模块进行构建，最优模型由1个氢键受体、1个氢键供体、1个疏水基团、1个芳香环和5个排除体积组成，预测训练集化合物活性相关系数为0.8764，测试集相关系数为0.7058，辨识有效性指数N为3.304，综合评价指数CAI为2.616；以KATP同源模建模型（PM0079770）为研究对象，构建基于受体的药效团模型（structure-based pharmacophore，SBP），最优模型具有6个氢键受体、8个氢键供体、7个疏水基团和18个排除体积，辨识有效性指数Ⅳ为2.200，综合评价指数CAI为2.017。分别用2个最优模型对TCMD数据库进行筛选，对候选化合物进行Lioin-ski五规则及ADMET性质预测研究，LBP模型命中171个化合物，SBP模型命中178个化合物。利用分子对接技术分别对上述2组潜在中药活性成分进行评价，按照打分值由大到小的排序，分别选取对接Dose个数的前3%为潜在活性化合物。得到由LBP模型虚拟筛选得到的10个化合物、由SBP模型虚拟筛选得到的2个化合物，共12个具有潜在KATP开放活性的中药成分。该研究为发现新的KATP开放剂提供了思路 [关键词]降压；钾离子通道开放剂；药效团；分子对接 高血压是常见的心血管危险疾病，病因病机复杂，其治疗原则是在降低血压的基础上，改善或逆转因高血压导致的器官损害。钾离子通道开放剂（potassium channel opener，PCO）是近几年来发现的新型心血管类药物，其作用机制为通过促进钾离子外流和抑制钙离子内流，使血管平滑肌松弛而导致血压下降。在血管中主要表达的钾离子通道有内向整流钾离子通道（inward rectifier potassiumchannel，Kir）、钙激活钾通道（calcium-activated po-tassium channel，KCa）、电压门控钾通道（voltage-ga-ted potassium channel，kv）和ATP敏感钾通道（ATP-sensitive potassium channel，KATP）4类钾通道。有研究发现，Kir，Kv，KCa均不参与盐酸埃他卡林诱导的扩血管作用，而KATP的特异性阻断剂格列苯脲则可显著拮抗盐酸埃他卡林的作用，提示盐酸埃他卡林的扩血管作用与KATP有关。因此，KATP相对于其他类型钾离子通道具有较好的调节血管张力作用，对KATP开放剂的研究将有助于新型降压药物的发现 药效团构建包括基于配体构建药效团和基于受体结构构建药效团2种方法。基于配体构建药效团可用于发现对同一靶标有相同作用的配体分子，基于受体构建药效团则集合了受体的空间结构及其与配体的相互作用等信息，是对前者的补充和提高，两者结合能有效降低药效团模型的漏筛率。本文分别构建基于配体和基于受体的2种KATP开放剂药效团模型，筛选中药活性成分，并结合分子对接技术对筛选结果进行评价，发现具有潜在KATP靶标开放活性的中药降压成分 1 材料与方法 1.1 基于配体的药效团模型构建及评价 采用Discovery Studio（DS，version 4.0）中的3D-OSARpharmacophore（Hvpogen）模块，构建基于配体的钾离子通道开放剂定量药效团模型。训练集与测试集中的活性化合物为来自The Binding Database（http：///bind/index.jsp）及文献报道的对人源KATP具有开放活性的48个化合物，活性值EC20范围70～30000nmolL-1，其结构与EC20见图1，2 采用Best的方法（能量间隔10kJmol-1，最大构象数目255个）对训练集进行构象分析，得到训练集化合物的多个局部最小能量构象。根据Fea-ture Mapping对训练集药效团特征的识别结果，训练集中包含特征氢键受体（hydrogen bond acceptor，A）、亲脂性氢键受体（hydrogen bond acceptor lipid，Ali）、氢键供体（hydrogen bond donor，D）、疏水基团（hvdro