简介02数据库检索20142.pptVIP

2.5 结构数据库 结构数据库收集并贮存生物大分子三维结构原始测量数据，其中主要是蛋白质分子三维结构数据库。 生物大分子的三维结构数据格式文件可通过特定的显示软件而直观地以图形方式表示出来。 2.5.1 蛋白质结构数据库 主要的蛋白质三维结构数据库是PDB（Protein Data Bank）数据库。此外，NCBI的Structure数据库（MMDB，the Molecular Modeling Database）也包含PDB的全部数据。 生物大分子的三维结构X射线衍射测量数据均以文本文件形式贮存，其后缀为.pdb，可用专门的软件打开或显示。 2.5.2 三维结构显示软件 常用的生物大分子三维结构显示软件包括：RasMol软件（Bernstein HJ）和Cn3D软件（NCBI）和Swiss-PdbViewer（SIB）等。 下载地址（适用于Windows XP）： /software/RasMol_2.7.5_Windows_Installer.exe /cn3d/Cn3D-4.3.msi http://spdbv.vital-it.ch/download/binaries/SPDBV_4.10_PC.zip 为了帮助用户从浩如烟海的生物实验数据中获取有用的数据资料，并对数据进行科学的分析和处理，各生物信息数据库系统均开发了一系列的实用工具软件，主要的有： GQurey —— N