评价遗传多样性的统计方法课件.ppt

(4)有效等位基因数（Effective number of alleles, Ne） 有效等位基因数是反映群体遗传变异大小的一 个指标，其数值越接近所检测到的等位基因的绝对数，表明等位基因在群体中分布越均匀。 1、群体内基因多样性 Pi 为第i 个有效等位基因的频率 对同工酶资料而言，群体间基因多样性通常采用基因分化系数GST进行测度。 A、先计算所有群体内的基因一致性 S 是群体数 B、计算群体内平均基因多样性 2、群体间基因多样性 C、总群体的基因一致性为 Wk 是第K 个群体的比例权重 D、群体间基因多样性为 2、群体间基因多样性 基因分化系数GST GST ——基因分化系数，度量的是群体间的基因多样性 HT ——群体间的基因多样性 HS ——群体内的基因多样性 2、群体间基因多样性 Hs 是群体内期望杂合度的平均值 P为每个群体中第k个座位上的第i个等位基因的平均频率 对RFLP 而言，群体间的基因多样性为 C i 是n个序列问在位置i 的酶切位数; 2、群体间基因多样性 对DNA 序列资料而言， 基因分化的测度为 dt是群体内和群体间所有配对距离的平均值 ds 是群体内平均配对比较距离 Chakraborty （1 974 ）提出了GST 的取样方差的一个近似公式: 2、群体间基因多样性 (2)基因流 由不同繁育种群