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第二章 蛋 白 质 本章重点内容 20种蛋白质氨基酸的分子结构、分类、性质 蛋白质的结构 蛋白质的性质 2.1蛋白质的概念、功能 2.1.1 概念 蛋白质(protein)是由许多氨基酸(amino acids)通过肽键(peptide bond)相连形成的一类含氮的高分子化合物。 2.1.2 蛋白质的生物学重要性 一. 蛋白质是生物体重要组成成分 分布广：所有器官、组织都含有蛋白质；细胞的各个部分都含有蛋白质 含量高：蛋白质是细胞内最丰富的有机分子，占人体干重的45％，某些组织含量更高，例如脾、肺及横纹肌等高达80％ 小结： 蛋白质是氨基酸以肽键连接而成的生物大分子 具有多样性 (e.coli 3000; human bodies 100000; nature 1010-1012) 生物学功能的执行者 复杂的分子结构赋予蛋白质特定的生物功能 基因表达的重要产物 2.2 蛋白质的化学组成 基本元素组成 C H O N S 氮含量在各种蛋白质都比较接近，大约15％-17％, 平均 16 % 16%的倒数——6.25 6.25的涵义 如果样品含1g氮,相当于样品中粗蛋白含量6.25 g. 例： 如果某生物样品中氮的含量3.0 g, 试计算样品中的蛋白质浓度 18.75 g 2.3 氨基酸(AA) 自然界中所有蛋白质都主要是由20种蛋白质氨基酸组成的 (1)(-NH2) ， (-COOH) (2) ?-C (3) R=H, glycine(4) D-,L-amino acid 2.3.2 AA的分类 2.3.3 AA的解离 等电点(pI) : AA所带净电荷为0的环境pH。 酸性AA: pI=1/2(pK1’+pK2’) alkaline amino acid: pI=1/2(pK2’+pK3’) 例： Glu (pI=3.22）,在pH 6.0时，Glu带何种电荷? *氨基酸的反应 2.4 蛋白质的结构 一级结构 二级结构 三级结构 四级结构 2.4.1 一级结构 肽键 一个AA的?-amino和另一个AA的?- carboxyl缩合脱水后形成的键 AA残基的概念 肽的概念 低聚肽(不多于25个AA残基) 多肽 (25个AA残基) *肽平面的存在 ? 肽的书写规则：?-NH2 置于左侧,?-COOH置于右侧，AA残基间以连字符表示肽键。e. g. H2N-serine-leucine-phenylalanine-COOH Ser-Leu-Phe / S-L-F 蛋白质的一级结构 蛋白质的一级结构是指蛋白质多肽链中氨基酸的连接顺序和二硫键的位置 。 一级结构是蛋白质分子结构的基础，它包含了决定蛋白质分子所有结构层次构象的全部信息 。 蛋白质肽链内和肽链间二硫键示意图 牛胰核糖核酸酶的氨基酸顺序 牛胰岛素氨基酸序列 2.4.2 二级结构 蛋白质的二级结构指多肽链共价主链的有规则的折叠和盘绕方式。 两种最常见的二级结构: ?-螺旋 ? -折叠 ?-螺旋 1. ?-螺旋的结构要点 螺旋每上升一圈，包含3.6个AA残基，，螺距 0.54 nm 每个AA残基沿轴上升0.15 nm；螺旋上升时，每个AA残基沿轴旋转100。 AA残基侧链伸向螺旋体的外侧。 氢键的形成: 每个AA残基的氨基氢（N-H）与前面第四个AA残基的羰基氧（C=O）形成氢键。 * 氨基酸残基种类与?- 螺旋结构形成的关系 ?-折叠 2. ?-折叠的结构要点 ?-折叠是蛋白质的一种充分伸展的结构。 氢键: 肽键的羰基氧与位于不同或者同一肽链的氨基的氢形成氢键。 ?-折叠结构中的相邻多肽链可以是平行式或反平行式。 3. 蛋白质二级结构的其它形式 ?-转角 无规卷曲 ?-转角 5.结构域 结构域是球蛋白的折叠单位。是多肽链在超二级结构的基础上进一步折叠成的致密的近似球状结构。 对于多数较大的蛋白分子或亚基，多肽链由两个或以上的结构域缔合形成三级结构。 免疫球蛋白的结构域 2.4.3 三级结构 蛋白质三级结构指多肽链上的所有原子在空间的排布。 *只有球蛋白具有三级结构。 抹香鲸肌红蛋白的三级结构 血红蛋白的三级结构 蛋白质三级结构的要点： 三级结构一旦形成，蛋白质就具有了生物活性 多肽链的大部分疏水侧链都被包埋在球的内部，而极性侧链则分布于球的表面 (形成亲水表面疏水核的结构)。 维系蛋白质三级结构的作用力