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第十一章 DNA损伤、修复和基因突变 第一节 DNA损伤 DNA损伤即是指在生物体生命过程中DNA双螺旋结构发生的任何改变。 DNA损伤大体上可以分为两类:单个碱基改变和结构扭曲。 一、自发性损伤 1. 复制中的损伤 复制中的损伤指复制过程中碱基配对时发生的误差再经过DNA聚合酶“校读”和单链结合蛋白等综合因素作用下仍然存在的DNA损伤。正常情况下,大肠杆菌复制过程中的错配率为10-10左右。 影响复制过程诸因素中的某一环节出现问题,错配率就会增高,如DNA本身功能和底物的改变,二价阳离子的改变等。 2. 碱基的自发性化学改变 这类损伤包括互变异构、碱基的脱氨基作用、自发的脱嘌呤和脱嘧啶、以及细胞代谢产物对DNA的损伤。例如,腺嘌呤的互变异构体(A’)可以与胞嘧啶配对,模板链上存在这些异构体的时候,子代链上就可能发生错误,形成损伤。细胞呼吸的副产物O2-和H2O2都能造成DNA的氧化损伤。 二、物理因素引起的损伤 1. 紫外线引起的DNA损伤 紫外线(UV)照射引起的DNA损伤主要是形成嘧啶二聚体。 2. 电离辐射引起的DNA损伤 电离辐射对DNA的损伤有直接效应和间接效应两种途径。前者指辐射对DNA直接沉积能量,并引起理化改变;后者是指电离辐射在DNA周围环境的其它成分上沉积能量,而引起DNA分子的变化。电离辐射的结果可以引起DNA的碱基损伤、链断裂以及DNA的交联。 三、化学因素引起的DNA损伤 1.烷化剂对DNA的损伤 烷化剂是一类亲电子的化合物,极容易与生物体内的有机物大分子的亲核位点起反应烷化剂核DNA作用时,就可以将烷基加到核酸的碱基上去。DNA链上的磷酸二酯键被烷化则形成不稳定的磷酸三酯键,可能在糖与磷酸间发生水解作用,导致DNA链的断裂。 2. 碱基类似物对DNA的损伤 碱基类似物是一类结构与碱基相似的人工合成的化合物,它们进入细胞以后,便能替代正常的碱基而掺入到DNA链中,干扰了DNA的正常合成。最常见的碱基类似物是5-溴尿嘧啶(5-BU)。 第二节 DNA修复 为了保证遗传信息的高度稳定性,生物细胞在进化过程中形成了一系列多步骤的修复机制。 目前对DNA损伤和修复的研究还不多,仅限于辐射-生物反应方面。 一、切除修复 1. 碱基切除修复(base excise repair,BER) BER可以去除因脱氨基或碱基丢失,无氧射线辐射或内源性物质引起的环氮类的甲基化等因素产生的DNA损伤。 BER是维持DNA稳定的重要修复方式,其步骤是N-糖苷键水解,从而切除发生变化的碱基。碱基释放过程是由DNA糖苷酶催化的。 2. 核苷酸切除修复(nucleotide excise repair, NER) NER可以修复UV照射形成的嘧啶二聚体以外,还能消除体内产生的各种嘌呤和嘧啶加合物。NER的关键特征是对损伤的DNA链的两端进行切割。 NER在已研究过的真核生物中都很相似,说明其在进化过程中高度保守。 二、直接(回复)修复 直接修复即简单地把损伤的碱基回复到原来状态的修复,可分为以下几种: 1. O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶直接修复 通过从O6-甲基鸟嘌呤上把甲基直接转移到酶的半胱氨酸残基上来直接回复DNA的损伤。 2. 光解酶复活 酶学光复活过程是修复UV导致的环丁烷嘧啶二聚体的直接机制,这种修复具有高度的专一性。 3. 单链断裂修复 DNA单链断裂是损伤的一种常见形式,可以通过DNA连接酶的重接而修复。 三、错配修复 错配修复可以纠正几乎所有的错配。此外对于对于插入或删除引起的DNA遗传信息的改变也有作用。 错配修复是以底物链上的信息为模板进行的,因此这个系统有区分底物链和新合成链的机制,细胞通过识别DNA链的甲基化状态来区分底物链和新合成的链。整个修复过程可以分为识别、切除和修补等步骤。 四、交联修复 链间交联是由多种多样的致癌剂和化疗药物等引起的。大肠杆菌和哺乳动物细胞内都存在这种修复机制,但细节还不清楚。 五、双链断裂修复 双链断裂(DSB)发生在体细胞重组和转座的生理条件下,也是电离辐射和氧化应激的主要损伤形式。依赖DNA的蛋白激酶对哺乳动物细胞中的双链断裂重接是必需的。 六、转录和修复 从目前的研究来看,修复发生于转录的整个过程,如激活、起始和延伸都与修复有关。在转录激活过程中,主要是AP-1和NF-KB两种转录因子可能参与转录-偶联修复。在转录起始过程中转录辅助因子TFII H也是一种修复因子。转录的延伸过程中,转录的序列修复比非转录的序列更迅速。 七、大肠杆菌的挽回系统 挽回系统(retrieval system)也称“复制后修复”(post-replication repair)因为它们在复制后起作用,也称为“重组修复”(reco
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