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基干数字PCR荧光检测仪软件系统设计模型
基干数字PCR荧光检测仪软件系统设计模型 【摘 要】数字PCR一般包括两部分。即PCR的扩增和荧光信号分析。在PCR扩增阶段。利用数字PCR先将样品稀释到单分子水平[1],平均到几十到几万个单元中进行化学反应,使得各个反应单元中目标分子是0或者1,使得目标分子阳性信号得以检测。实验会利用上端软件控制实验室其中一台PCR子仪器的运行,对仪器中的数据进行采集,以及对科学采集到的数据进行分析和处理,便于对基因的定量分析和检测。该软件要控制其中一台PCR仪器的运行和工作。另外这台仪器会通过USB接口把采集的数据上传到PC端,通过PC端的软件程序进行分析和处理。最后得出实验结论
【关键词】数字PCR;荧光检测仪;数据分析;生命科学与计算机;仪器控制
The Software System Design Model Based on Digital PCR Fluorescence Detector
LI Xin-xin WU Shao-fei
(Wuhan Institute of Technology School of computer science and Engineering,Wuhan Hubei 430205,China)
【Abstract】Digital PCR generally includes two parts. That is, the PCR amplification and fluorescence signal analysis. In the PCR amplification stage. Using digital PCR to dilute samples onto a single molecule level[1], the average to dozens to tens of thousands of units in chemical reaction, make each reaction unit of target molecules is 0 or 1, makes the target molecules positive signal detection. One of them will use the upper software control laboratory PCR instrument operation, instrument of the data acquisition, as well as to the scientific analysis and processing the data collected, is advantageous for the quantitative analysis of the gene and detection. The software to control one PCR instrument operation and work. In addition this instrument will collect data uploaded to PC through USB interface, through analysis and deal with the PC software. Finally experimental conclusions.
【Key words】Digital PCR; Fluorescence detector; Data analysis; Life sciences and computer; Instrument control
0 引言
社??在不断地进步,人们的生活方式在提高,物质条件也在逐步改善,越来越多的人在享受高品质生活的同时,也愈加得关注个人的身体健康。数字PCR这种分子检查技术除了用于疾病的预测及早期诊断外,还将用来指导人们的常规体检,让常规体检更具有针对性,从而改变人们的健康管理的观念。除此之外,它还可以用来指导人们管理疾病,进而指导病人安全用药,可以帮助医生规划针对个体病人的治疗措施,以便人们对疾病的治疗更加有的放矢
核酸分子的定量最常见的有三种方法;(1)利用核酸分子对光的吸收度的不同进行测量;(2)在PCR反应体系中添加荧光探针,用荧光信号来实时监控PCR反应过程,最后用标准曲线对未知模板处理[2];(3)数字PCR将微量样品进行大量分级的稀释和分液处理,使待测分子数不超过1个,在进行PCR的扩增,使得含有1个目标分子的样品放大至几百万倍,产生强大的荧光信号,对发生了扩增反应的样品计数[3]
1 数字PCR检测原理
数字PCR是一种基于单分子模板PCR扩增,进行核酸拷贝
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