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荷斯坦公牛SPAG11基因、Tf基因多态性及与精子质量性状的关联性分析论文
山东师范大学硕士论文
英文缩写说明
英文缩写 英文全称 中文名称
SPAG11 Sperm-Associated Antigen 11 精子相关抗原11
TF Transferrin 转铁蛋白
SNP single nucleotide polymorphism 单核苷酸多态性
MAS Marker-assisted selection 分子标记辅助选择
QTL Quantitative trait locus 数量性状位点
dNTP Deoxy muletide triphosphate 脱氧核苷三磷酸
NCBI National Center for Biotechnology Information 美国国家生物信息中心
EB Ethidium bromide 溴化乙锭
SSCP single-strand conformational polymorphism 单链构象多态性
RFLP restriction fragment length polymorphism 限制性片段长度多态性
CRS Created Restriction Site 创造酶切位点
PAGE polyacrylamide gel electrophoresis 聚丙烯酰胺凝胶电泳
TEMED N,N ,N,N-Tetramethylethylene-diamin N ,N ,N ,N’ -四甲基乙二胺
AP ammonium persulfate 过硫酸铵
PIC polymorphism information content 多态信息含量
He heterozygosities 杂合度
Ne effective number of allele 有效等位基因数
1
山东师范大学硕士论文
荷斯坦公牛SPAG11 基因和Tf 基因多态性及与精子质量性状的
关联性分析
摘要
种公牛的精液品质对牛群的发展和品质改良起着极其重要的作用。尤其在人
工授精和冷冻精液日益普及的今天,种公牛的作用更为重要。但种公牛的精液品
质是受多基因控制的数量性状,通过常规育种方法选择周期长,效率低。随着分
子生物学技术在动物育种上的应用,可对目的动物实现早期选择,显著提高选种
效率。本研究选择与精子成熟及运动相关的SPAG11和Tf基因作为候选基因,以全
国三大公牛站北京、上海和山东434头存栏公牛作为试验材料,通过PCR-SSCP,
PCR-RFLP和DNA测序等方法检测SPAG11基因和TF基因中单核苷酸多态性(SNPs)位
点,并分析这些SNPs位点及其不同单倍型与荷斯坦公牛的精液品质性状的关联
性,筛查影响公牛精液品质性状的相关分子标记,为未来培育高繁殖性能的公牛
提供参考依据。
一.SPAG11 基因多态性与公牛精子性状关联性分析
精子相关抗原11 (Sperm-Associated Antigen 11 ,SPAG11)是β-防御素的一
种,主要在哺乳动物的附睾和雄性生殖道中表达,参与雄性生殖道的先天免疫,
在附睾中参与精子的成熟,此外还参与透明带的识别和精卵结合等事件。
本试验扫描了SPAG11 基因,发现了6 个新SNPs 位点,分别为g.1306GA,
g.1454GA,g.16904GT,
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