棉花适宜机采相关性状的SSR标记关联分析和优异等位基因.PDF

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 棉花适宜机采相关性状的SSR 标记关联分析及优异等位基因挖掘 1,** 1,2,** 1 1 1 1,* 王 娟 董承光 刘 丽 孔宪辉 王旭文 余 渝 1 2 新疆农垦科学院棉花研究所 / 农业部西北内陆区棉花生物学与遗传育种重点实验室 新疆石河子 832000; 新疆农业大学农学院 新疆乌 鲁木齐 830052 摘 要:棉花机械采收对品种的生育期、株型及对脱叶剂敏感度有较高的要求。本研究利用覆盖全基因组有多态性的 214 对SSR 标记对118 份含有一个或多个机采性状的种质资源的株高、始节高、始节位、第一果枝平均长度、生育期及脱叶率6 个机采相关性状进行关联分析。利用Structure 2.3.1 软件进行群体结构分析,并结合2 年2 点12 个重复的田间表型数据,采 用Tassel 5.0 软件的混合线性模型MLM 关联定位。结果检测到460 个等位基因,涉及905 个基因型,基因多样性指数平均 为0.5151,PIC 值平均为0.4587,基因多样性指数和PIC 值都大于平均数的标记有99 个,占总标记数的46.3 ,说明该批 SSR 标记具有较多的等位变异数和较高的遗传多样性。群体结构分析将118 份供试材料划分为4 个亚群,结果显示各类群中 材料与地理来源无对应关系。关联分析结果显示4 种环境中,在显著条件下(P0.05) ,共检测到 124 个与6 个机采相关性状 相关的位点,对表型变异解释率范围为2.23 ~ 14.15 ;其中在极显著条件下(P0.01) ,共检测到20 个与机采相关性状相关 的位点,对表型变异解释率范围为4.84 ~ 14.15 。基于本研究的结果,鉴定出典型的载体材料 11 份,分别为系7、金垦9 号、Y11 、豫棉18、AY-4 、K2 、朝阳棉2 号、DZ22 、中棉所43 、C2、关农长早B14 。以上发掘出的控制棉花适宜机采性状 的优异等位基因及优异亲本资源,可为机采棉的分子辅助选择育种提供理论依据。 关键词:棉花;机采相关性状;关联分析;等位变异 Association Analysis and Exploration of Elite Alleles of Mechanical Harvest-Related Traits with SSR Markers in Upland Cotton Cultivars Gossypium hirsutum L.) 1,** 1,2,** 1 1 1 1,* WANG Juan , DONG Cheng-Guang , LIU Li , KONG Xian-Hui , WANG Xu-Wen , and YU Yu 1 Cotton research Institute, Xinj iang Academy of Agricultural and Reclamation Science / Key Laboratory of China Northwestern Inland Region,

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