簇毛麦基因组特异DNA序列标记的建立与应用.PDFVIP

麦类作物学报 　2006 ,26 (4) :1～5 J ournal of Triticeae Crop s 簇毛麦基因组特异 D NA 序列标记的建立和应用 迟世华 ,杨足君 ,冯 　娟 ,周建平 ,刘 　成 ,任正隆 ( 电子科技大学生命科学与技术学院 , 四川成都 6 10054) 摘 　要 : 为建立簇毛麦基因组特异 DN A 序列的分子标记 , 以普通小麦中国春 、绵阳 11 、川农 17 和 R 111 以及多年生簇毛麦 、硬粒小麦多年生簇毛麦双二倍体 TDB3 为材料 ,用 120 条随机引物进行 RA PD 分析 , 筛 选出一个多年生簇毛麦 的特异性 RA PD 片段 , 克隆测序表 明该片段全长为 937 bp ( 记为 O PM2937 ) 。以 O PM2937 的DN A 序列为基础设计了一对特异引物 , 并用该特异引物对多年生簇毛麦 、二倍体簇毛麦以及中 国春二倍体簇毛麦附加系 CSDA 1V ～CSDA7V 与小麦多年生簇毛麦衍生后代进行了扩增 ,结果表明 ,凡具 有簇毛麦染色体 的材料均可扩增 出 目标 DN A 片段 , 而不具簇毛麦染色体 的材料均未能得到扩增 。将 O PM2937 在 N CB I 中进行序列比对 ,发现它是一个新的序列 ,说明 O PM2937 为簇毛麦基因组的一个特异序列 , 该 DN A 序列标记可用于快速跟踪检测小麦背景中的簇毛麦染色体 。 　　关键词 : 簇毛麦属 ;RA PD ; 基因组特异性 DN A 片段 　　中图分类号 :S5 12 . 9 ; S326 　　　　文献标识码 : A 　　　　文章编号 (2006) 04000 105 Development and Appl ication of A D a s y p y r um Genomespecif ic D NA Marker CHI Shihua , YANG Zuj un , FENG Juan , ZHOU Jianping , L IU Cheng , REN Zhenglong ( College of Life Science and Technology , U niver sit y of Elect ronic Science and Technology ,Chengdu , Sichuan 6 10054 , China) Abstract : Rando m amp lified polymorp hic DN A ( RA PD) analy si s wa s p erfor med on co mmon w heat line s Chine se Sp ring , Mianyang 11 , Chuannong 17 , an d R 111 , a s well a s D asy p y r um brev i a ris t at um , T ri t icum d u r um D . brev i a ris t at um amp hip loid wit h 120 ran do m p rimer s , and a D . brev i a ris t at um sp ecific RA PD f ragment wa s obt ained . The f ragment of 937 bp wa s revealed by clo ning and sequen cing , w hich wa s t hu s de signat ed a s O PM2937 . Ba sed on t he sequence of O PM2937 , A p air of p rimer wa s develop ed , and u sed to amp lif y t he D . brev i a ris t at um , D . v i l l os um , T. aes t i v um Chi nes e S p ri ng D . v i l l os um addition line s CSDA 1V to