分子克隆操作技术注意事项
引物设计
设计模板:基因过表达的设计模板为mRNA(根据基因名称和样品种属从NCBI查询), 启动子(转录调控区域)的设计模板为基因组DNA片段(根据基因名称和种属从UCSC查询,并在NCBI核实序列),DNA甲基化分析(CpG岛,根据基因名称和种属从UCSC查询,并在NCBI核实序列);
设计软件:Vector NTI用于设计过表达引物,Vector NTI用于设计启动子(转录调控区域)克隆引物;Methprimer用于设计DNA甲基化分析引物(BSP, MSP)
5’和3’端的酶切位点和保护性碱基
所用的载体的多克隆位点(MCS)有,所克隆的序列没有,可以同时做双酶切,我们的酶库有,价格便宜的,加了保护性碱基可以直接进行PCR产物酶切的(详情见《保护性碱基.doc》);
引物溶解
引物的储液浓度为100μM, 计算加入灭菌水的量;
打开管盖前,必须先12000RPM离心2min,因为引物为粉末,容易飘出;
加入灭菌水溶解前,应稍微打开管盖即可,以免粉末飘出;
引物溶液应-20℃保存;
引物使用的工作液浓度为10μM, 需要多少稀释多少,剩余的应丢弃;
PCR
操作注意事项:操作前,应熟知所用PCR酶的说明书,并熟知说明书标示的注意事项(引物、模板和酶的建议用量,变性温度及时间,延伸速度等),PCR是极为灵敏的技术,因此要决定避免交叉污染,注意冰上操作,
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