生物化学(沈同第三版上)典型概念的整理.docVIP

发酵生长因子 从广义上讲，凡是微生物生长不可缺少的微量的有机物质，如氨基酸、嘌呤、嘧啶、维生素等均称生长因子 肽平面：由于羰基碳-氧双键的靠拢，允许存在共振结构（resonance structure），碳与氮之间的肽键有部分双键性质，由CO-NH构成的肽单元呈现相对的刚性和平面化，肽键中的4个原子和它相邻的两个α-碳原子多处于同一个平面上。 超二级结构：蛋白质分子中，特别是球状蛋白质中，由若干相邻的二级结构单元（即α—螺旋、β—折叠片和β—转角等）彼此相互作用组合在一起，形成有规则、在空间上能辨认的二级结构组合体，充当三级结构的构件单元，称超二级结构，已知的超二级结构有3种基本组合形式：αα、βαβ、ββ。 结构域：二级结构及超二级结构的基础上，多肽链进一步卷曲折叠，组装成几个相对独立、近似球形的三维实体。结构域是球状蛋白的折叠单位，多肽链折叠的最后一步是结构域间的缔合。结构域的概念有三种涵义:即独立的结构单位、独立的功能单位和独立的折叠单位。类型： α -螺旋域； β -折叠域； α+β域； α /β域；无规则卷曲+β-回折域；无规则卷曲+ α -螺旋结构域，对于较小的蛋白质分子或亚基来说，结构域和三级结构往往是一个意思，就是说这些蛋白质是单结构域的。 变性作用：白质各自所特有的高级结构，是表现其物理性质和化学特性以及生物学功能的基础。当天然蛋白质受到某些物理因素和化学因素的影响，使其分子内部原有的高级构象发生变化时，蛋白质的理化性质和生物学功能都随之改变或丧失，但并未导致其一级结构的变化，这种现象称为变性作用（denaturation）变性的实质：次级键（有时包括二硫键）被破坏，天然构象解体。变性不涉及一级结构的破坏。 核酸变性指核酸双螺旋区的氢键断裂，变成单链，不涉及共价键断裂。★变性因素： 热变性 酸碱变性（pH小于4或 大于11）变性剂（尿素、盐酸 胍、甲醛） ★变性后的理化性质： 260nm吸收值升高。 粘度降低，浮力密度 升高。二级结构改变，部分失活。 DNA的变性是爆发式的，变性作用发生在一个很窄的温度范围内。 亚基一般是一条多肽链，有时也称单体。本身具有球状三级结构。 等电点：在某一pH，它所带的正电荷与负电荷相等。蛋白质的等电点和它所含的酸性氨基酸残基和碱性氨基酸残基的比例有关。 等离子点：没有其它盐类干扰时，蛋白质质子供体解离出的质子数与质子受体结合的质子数相等时的pH值称等离子点，是每种蛋白质的特征常数。 增色效应：核酸发生变性时，摩尔磷吸光系数?（P）升高约25%，此现象为增色效应； 减色效应: 复性后摩尔磷吸光系数?（P）又降低的现象。原因双螺旋结构使碱基对的π电子云发生重叠，减少了对紫外光的吸收。 分子杂交 来源的DNA单链间或单链DNA与RNA之间只要有碱基配对的区域，在复性时可形成局部双螺旋区，称核酸分子杂交(hybridization)。 熔解温度（Tm）DNA的双螺旋结构失去一半时对应的温度称为熔解温度（Tm）。 影响DNA的Tm值的因素 ①DNA均一性 均一性高，变性的温度范围越窄，据此可分析DNA的均一性 。 ②G-C含量与Tm值成正比测定Tm，可推知G-C含量。G-C%=(Tm-69.3)×2.44 ③介质中离子强度 14．活性中心：酶分子中结合底物并起催化作用的少数氨基酸残基，包括底物结合部位（决定酶的专一性）、催化部位（决定酶所催化反应的性质）。. 15．别构效应 别构部位与配体的结合可影响其他亚基，使这些亚基构象改变，增强或减弱对底物的结合 酶分子的非催化部位与某些化合物可逆地非共价结合后导致酶分子发生构象改变，进而改变酶的活性状态，称为酶的别构调节 同工酶 存在于同一种属或不同种属，同一个体的不同组织或同一组织、同一细胞，具有不同分子形式但却能催化相同的化学反应的一组酶，称之为同工酶（isoenzyme）。 转换数（turnover number）的概念：一定条件下，每秒钟每微摩尔酶分子能催化底物发生变化的微摩尔数，用kcat表示。K3代表酶被底物饱和时每秒钟每个酶分子转换底物的分子数，称为转换数（或催化常数，Kcat）， 表明酶的最大催化效率。 18竞争性抑制（Competitive inhibition）抑制剂具有与底物类似的结构，竞争酶的活性中心，并与酶形成可逆的EI复合物，阻止底物与酶结合。可以通过增加底物浓度而解除此种抑制。 19．非竞争性抑制（noncompetitive inhibition）.底物和抑制剂可以同时与酶结合，但是，中间的三元复合物ESI不能进一步分解为产物，因此，酶的活性降低。抑制剂与酶活性中心以外的基团结合，其结构可能与底物无关。不能通过增加底物浓度的办法来消除非竞争性抑制作用。 20．反竞争性抑制 .