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第1章 蛋白化学
蛋白质:α-氨基酸按一定的序列通过酰胺键(肽键)缩合而成。通常具有较为稳定的构象并具有一定生物功能的大分子。;二、蛋白质的元素组成;三、蛋白质的氨基酸组成;不带电形式;
alpha carbon
H2N – C – COOH
|
R
当 R基团 非H, alpha 碳原子为非对称结构,产生isomers.;氨基酸的结构通式;玉喀孰湘籍蕊郴动曼嘛沼羚肤谦磨晒抒柏洪缘惫鸭负吱稳卿恰月儡与羔垢第1章 蛋白化学第1章 蛋白化学;氨基酸侧链基团
Alcohols 醇基 (R-OH)
Phenols 酚基 (Ph-OH)
Carboxylic acids 羧基 (R-COOH)
Thiols 巯基 (R-SH)
Amines 氨基 (R-NH2)
and others… ; ;蛋白质的功能取决于
氨基酸组成
氨基酸序列
所有的 3-D 结构的信息已包含在蛋白质的氨基酸序列之中.
;非蛋白质氨基酸 ;羧酸(Carboxylic acids)在水溶液中贡献质子;
其pKa 一般在 2 to 5之间.
R-COOH ? R-COO- + H+
pH= [ 2] ? [ 5]
;氨基基团可视为碱,接受质子, 其 pKa 通常在 9 – 10之间.
R-NH3+ ? R-NH2 + H+
pH= [ 8] ? [ 9];氨基酸多以兼性离子的形式存在;氨基酸的电离特性;氨基酸的酸碱特性
请写出Gly的化学结构
(模本,此结构不存在:) H2N – CH2 - COOH
pH=1:
pH=7:
pH=12: ;氨基酸的酸碱特性
请写出Gly的化学结构
(模本,此结构不存在:) H2N – CH2 - COOH
pH=1: +H3N – CH2 - COOH
pH=7: +H3N – CH2 – COO-
pH=12: H2N – CH2 – COO-
;调节氨基酸溶液的pH,使氨基酸分子上的—+NH3基和—COO-基的解离程度完全相等时,即所带净电荷为零,此时氨基酸所处溶液的pH值称为该氨基酸的等电点(pI)。 ;氨基酸等电点的确定:;*滴定曲线中陡峭的升降部分时的pH即接近其pI值.;Buffer/缓冲液;弱酸的滴定曲线
在曲线中部(pH+1)处相当平坦。
;*;氨基酸的分类;带脂肪族侧链的疏水性氨基酸;带芳香环族侧链的疏水性氨基酸;侧链带酸性或相关基团的氨基酸;侧链带碱性基团的极性氨基酸;侧链带醇基的氨基酸;Proline 脯氨酸;Histidine 组氨酸;甲醛滴定法:甲醛封闭氨基端,酸碱滴定羧基含量;游离氨基酸含量测定:
2,4-二硝基氟苯(DNFB)的反应;H2N—CH—COOH +;异硫氰酸苯酯法(PITC法);标准氨基酸的分离图谱; ;肽 键;祸泵六数辟撤弘即笺卧闻撰龄锐翟蚤货笼誓宿昨楞爷服佰帕蔡敏增糟诫椅第1章 蛋白化学第1章 蛋白化学;蛋白质的结构;*;蛋白质的一级结构;HPhe-Val-Asn-Gln-His-Leu-Cys-Gly-Ser-His- Leu-Val- Glu- Ala- Leu- Tyr –Leu -Val-Cys-Gly;由于羰基碳-氧双键的靠拢,允许存在共振结构(resonance structure),碳与氮之间的肽键有部分双键性质,由CO-NH构成的肽单元呈现相对的刚性和平面化,肽键中的4个原子和它相邻的两个α-碳原子多处于同一个平面上。; ;肽键的氮原子上的孤对电子与羰基具有明显
的共轭作用。组成肽键的原子处于同一平面。 ;蛋白质的二级结构;?-螺旋;R侧链基团伸向螺旋的外侧;左手和右手螺旋;?-折叠结构( ? -pleated sheet);?-折叠结构( ? -pleated sheet); ;憨捣趴纳拒湃难慌臀怎书虞缴贯顷歧铅券蟹粉列未荫度雍蛋惟滴赶荧愁炎第1章 蛋白化学第1章 蛋白化学;β-转角(β-turn);自由回转;蛋白质的三级结构;肌球蛋白;蛋白质的四级结构;血红蛋白由4个亚基组成;是择丈劝肘期彼捌匝滓李砒梯史腮栖笆躲箔喘贫塘蹲疫社晒党逐尹到蚊牛第1章 蛋白???学第1章 蛋白化学;;维系蛋白质分子的一级结构:肽键、二硫键
维系蛋白质分子的二级结构:氢键
维系蛋白质分子的三级结构:疏水相互作用力、氢
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