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杨树ISSR指纹图谱构建及应用研究论文
摘要
杨树是杨柳科(Salicacea)杨属(Populus)落叶乔木的通称,多年来我国在杨树基础科
学研究上取得了不少成就,但对其分子遗传变异和系统进化的研究还较少。随着杨树新品种
的相继产生,导致杨属植物在分类上存在相当大的混乱,造成品种混杂,遗传背景模糊等现
象,给遗传资源的开发和良种的推广应用带来很大的困难。传统的形态标记方法已明显不能
满足对杨树品种进行准确鉴别的要求,因此,运用可靠的检测方法研究杨属植物的遗传多样
性,对其亲缘关系进行分析,以合理利用、保存杨属基因资源,为其遗传改良提供科学依据,
在杨树育种工作中的亲本筛选和合理利用方面具有一定的实践价值。
本研究利用ISSR分子标记技术结合杨属植物的形态学特征对采集到的57份杨树样品进
行了遗传多样性研究和评价并且构建其 ISSR 指纹图谱,为更好的利用杨树种质资源打下良
好的基础,通过实验,得到了以下主要研究结果:
1.在银川植物园内收集了 57 份形态优美、适应性强、具有一定观赏价值的杨树优良个
体,包含了大部分西北地区常见杨树品种,具有一定代表性,其中 20 个杨树种为已知种,
分别来自于白杨派、黑杨派、胡杨派、青杨派。为杨树遗传多样性研究和种质资源合理利用
打下了基础。
2.建立和优化了适合杨树基因组 DNA 的 ISSR-PCR 反应体系和扩增程序,ISSR-PCR 反
2+
应总体积为 25μL ,其中包括 DNA 模板 40ng 、引物 0.4 μmol/L 、Mg 1.5mmol/L、dNTP
0.25mmol/L 、Taq 酶 0.5U 、H2 O 9.3μL 。扩增程序为:94 ℃预变性 3min ;94 ℃变性 30s ;
退火 30s ;72 ℃延伸 1min;72 ℃延伸 5min ,4 ℃保存。
3.通过查阅相关文献,从加拿大哥伦比亚大学最早公布的 100 条 ISSR 引物中成功筛选
出9 条可扩增出清晰条带、多态性丰富的引物用于杨树指纹图谱构建及其遗传多样性研究和
亲缘关系分析。
4.利用 ISSR 分子标记技术分析了白杨派、黑杨派、胡杨派、青杨派四大杨树派系 57
个杨树样品的亲缘关系,并构建了其指纹图谱。结果表明:在采集的 57 个杨树样品中,白
杨派样品所占比例较大,系谱关系比较规整,聚类结果也比较明显,但派系内部亲缘关系错
综复杂。其余三个杨树派系较早的聚为一类,这与形态特征的分类结果基本一致,可以作为
形态学分类与分子手段分类相互佐证的依据。
5.利用 ISSR 技术分析了 57 份杨树材料的亲缘关系,用 NYSTS2.1 软件计算了各杨树样
品间的遗传相似系数和遗传距离,并用 UPGMA 法进行了聚类分析,聚类结果表明,ISSR
标记技术可以初步鉴定各品种间的亲缘关系,另一方面,可将已知的 20 个杨树样品作为参
照,利用 ISSR 技术来鉴别其余 37 个遗传背景模糊的杨树样品,为杨树的选育提供准确的
实验参考。
关键词:杨树,ISSR,指纹图谱,遗传多样性
I
Abstract
Poplar is a common name of all tree species in genus Populus of family Salicaceae and is
characterized by rapid growth,high adaptability and wide employment. For many years,many
achievements in basic scientific research of poplar have been obtained in our country. Little is
currently known about the majority of poplar species occurring in molecular genetics variation
a
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