linux操作基础及perl编程基础.pptx

Linux操作基础及perl编程基础;Linux的发行版;为什么要用Linux;BMK计算集群;远程登录;远程登录;远程登录;Linux文件系统;Home directory;Linux命令行;常用命令——ls(list);常用命令——文件移动;常用命令——文件移动;常用命令——目录操作;常用命令——文件查看;常用命令——统计命令;常用命令——进程控制;常用命令——更改文件属性;常用命令——压缩和解压缩;常用命令——特殊符号;常用命令——其他命令;常用命令——帮助;Perl语言简介;为什么生物信息学使用Perl;编程基础;输入输出,用文件句柄打开文件，用钻石操作符（’’）读入文本,用print 命令输出，注意文件读写完成后及时关闭句柄。 open (IN,”$fIn”) or die $!; my $a=IN; #默认每次读入一行 open (OUT,”$fOut”) or die $!; print OUT “$a\n”; # 将$a中的值输出到$fOut文件中 close (OUT); close (IN); ;条件判断和循环 If 判断 if (…) { ….. }else{ ….. } If ($a1){ $b=$a; } ;逻辑操作符，‘’、‘||’ if ($a2 $a =10){ $b=$a; } if ($a==1 || $b