转录的机制.pptVIP

Eubacterial RNA Pol Subunits a2bb’s Holoenzyme a2bb’ Core bb’ Catalytic Center s Specific Promoter Recognition 每种RNA聚合酶都含有两个大亚基和12－15个小亚基，其中一些亚基为二种或三种RNA聚合酶所共有。研究得最清楚的真核生物RNA聚合酶是酵母的RNA聚合酶，编码酵母RNA聚合酶各亚基的基因已被克隆，并且被测序。RNA聚合酶各亚基也通过SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳得到了分离。 所有RNA pol Ⅱ的最大的亚基的C-端都含有一段七肽串联重复序列Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser，延伸形成一个尾巴，被称为羧基末端结构域（carboxyl-terminal domain，CTD）。酵母的Pol II的CTD中有27个这样的重复序列，哺乳动物中有52个重复，每一重复都包含特定的磷酸化位点。 二、RNA Pol I 负责转录的基因 1.核糖体RNA基因 rRNA是细胞内占优势的转录产物，占细胞RNA总量的80～90％。真核细胞中有4种rRNA，5S、5.8S、18S和28S rRNA。在真核细胞基因组中，18S、5.8S和28S rRNA基因构成一个转录单位，由RNA聚合酶I负责转录。5S rRNA则单独由RNA聚合酶III转录。 rRNA基因属于中度重复序列，集中成簇，形成rDNA。人类细胞在不同的染色体上分布有5个rRNA基因簇，每一rRNA基因簇含有许多转录单位，转录单位之间是非转录间隔区。 真核生物rDNA的编码区在各物种间显示很强的保守性，但是基因间的非转录间隔区和转录间隔区在长度和顺序上变异很大。非转录间隔区是rDNA中变化最大，也是十分重要的一个区域。它含有启动子，控制rRNA基因的转录；存在很多小段重复顺序，具有增强子功能；存在于转录终止有关的信号。 2.RNA Pol I promoter 人类的rRNA基因的启动子由核心启动子和上游控制元件两个部分构成。核心元件（core element）包括转录起始位点，跨越－45到＋20区域，可以单独起始转录。位于－180～－107的上游控制元件（upstream control element, UCE）可以显著提高转录效率。两种元件密切相关，二者有85％的序列一致性，并且富含GC。一般来说转录起始位点附近的序列富含AT，使DNA分子在此区段容易解螺旋。 3.upstream binding factor and selectivity factor I（上游结合因子和选择因子I） RNA聚合酶I需要两种辅助因子。UBF（upstream binding factor ）是一种DNA序列特异性结合蛋白，结合在UCE的上半段 。UBF是一种装配因子（assembly factor）。选择因子（selectivity factor 1, SL1）本身并没有启动子结合专一性。但是， 在UBF1与启动子结合后，SL1与UBF1－DNA复合物结合，也就是说SL1与启动子的结合需要UBF1的介导。SL1的结合使得RNA聚合酶I 结合到核心启动子上起始转录。 三、RNA Pol III genes: 5S rRNA and tRNA transcription RNA聚合酶III是一个至少由16种不同的亚基构成的复合体，与RNA聚合酶II一样也位于核质种。RNA聚合酶III负责5S rRNA、tRNA、无帽子结构的snRNA(small nuclear RNA)和snoRNA(small nucleolar RNA)的转录。 1.tRNA基因的转录 tRNA基因的启动子也位于转录起始位点之后，由两个非常保守的序列构成，分别被称为A框（5’-TGGCNNAGTGG-3’）和B框(5’-GGTTCGANNCC3’)。同时这两个序列还编码tRNA的D－环和TψC环。这意味着tRNA基因内的高度保守序列同时也是高度保守的启动子的序列。 转录因子TFIIIC可与启动子的A框和B框结合。 TFIIIB与A框上游序列结合。TFIIIB没有序列特异性，因此它的结合位点由TFIIIC在DNA上的结合位置决定。TFIIIB促使RNA聚合酶III与转录起始位点结合并起始转录。 2.rRNA基因的转录 与RNA聚合酶I转录的rRNA基因一样，5S rRNA基因也是串联排列形成基因簇。在人类基因组中有一个大约由2000个5S rRNA基因组成的基因簇。5S rRNA基因的启动子位于转录起始位点下游，转录区的内部，被分成两个部分，A框和C框。A可位于＋50～＋65，C框位于＋81～＋99。 5S rRNA基因启动子的C框是