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园 艺 学 报 2011 ,38 (3 ):487 –494 http: // www. ahs. ac. cn
Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com
津田芜菁 BrEGL3 cDNA 的克隆及表达分析
* *
闫海芳,李玉花,孙佰贺,许道琦,聂唯天,刘振华,闵远琴
(东北林业大学生命科学学院,哈尔滨 150040 )
摘 要:EGL3 (Enhancer of Glabra3 )蛋白是一种bHLH 类蛋白,是一类重要的转录调节因子。为阐
释 BrEGL3 在‘津田’芜菁(Brassica campestris L. ssp. rapifera ‘Tsuda ’)花青素生物合成中的调控作用,
根据拟南芥 EGL3 基因序列信息设计兼并引物,克隆获得了‘津田’芜菁 EGL3 基因的全长 cDNA 序列,
命名为 BrEGL3 ,其 GenBank 登录号为 HM208589 。序列分析结果显示,BrEGL3 全长 1 794 bp,包含编
码 597 个氨基酸的开放阅读框,分子量约为 66.8 kD 。氨基酸结构分析显示该蛋白含有DNA 结合域,该
结合属于螺旋—环—螺旋家族。氨基酸对比分析表明,BrEGL3 与萝卜 EGL3 蛋白相似性最高,其次为拟
南芥中的 EGL3 。荧光定量 PCR 检测 BrEGL3 在芜菁不同组织中的表达结果表明,该基因在有花青素合
成的红色芜菁根皮中表达量最高。
关键词:芜菁;EGL3 ;基因克隆;表达分析
中图分类号:S 631.3 文献标识码:A 文章编号:0513-353X (2011 )03-0487-08
Cloning and Expression Analysis of Enhancer of Glabra3 (BrEGL3 )in
Brassica campestris L. ssp. rapifera ‘Tsuda ’
* *
YAN Hai-fang ,LI Yu-hua ,SUN Bai-he,XU Dao-qi ,NIE Wei-tian ,LIU Zhen-hua ,and MIN Yuan-qin
(College of Life Sciences,Northeast Forestry University ,Harbin 150040,China )
Abstract :Enhancer of Glabra3 (EGL3 )is a bHLH protein that is an important transcript factor in
plant. In order to elucidate the regulation mechanism of EGL3 in ‘Tsuda ’anthocyanin biosynthesis,cDNA
of EGL3 gene was isolated from this plant by the method of RT-PCR using degenerate primers designed
according to Arabidopsis EGL3 (GenBank accession No. NM202351 ). This gene was named BrEGL3
(GenBank accession No. HM208589 ). BrEGL3 was 1 794 bp in full length open reading frame (ORF )
encoding 597 amino acids with the molecular weight of 66.8 kD. Software prediction results showed that
BrEGL3 contained a DNA helix-loop-helix binding
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