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NER不仅能够修复整个基因组中的损伤,而且能拯救因转录模板链损伤而暂停转录的RNA聚合酶,即参与转录偶联修复(transcription-coupled repair)。 作用方式:NER蛋白质被募集于暂停的RNA聚合酶。 转录偶联修复的意义:将修复酶集中于正在转录DNA,使该区域的损伤尽快得以修复。 碱基错配修复( mismatch repair) 错配是指非Watson-Crick碱基配对。 碱基错配修复也可被看作是碱基切除修复的一种特殊形式,主要负责纠正: ① 复制与重组中出现的碱基配对错误; ② 因碱基损伤所致的碱基配对错误; ③ 碱基插入; ④ 碱基缺失。 E.coli错配修复系统修复复制差错 目录 目录 DNA损伤与修复 DNA Damage and Repair 第十五章 各种体内外因素所导致的DNA组成与结构的变化称为DNA损伤(DNA damage) 其一,DNA的结构发生永久性改变,即突变 其二,导致DNA失去作为复制和/或转录的模板的功能 DNA损伤的后果: 生物多样性依赖于: DNA突变 DNA修复 平衡 DNA损伤 DNA Damage 第一节 一、多种因素通过不同机制导致DNA损伤 (一)体内因素 DNA复制错误 DNA自身的不稳定性 机体代谢过程中产生的活性氧 DNA复制错误: 在DNA复制过程中,碱基的异构互变、4种dNTP之间浓度的不平衡等均可能引起碱基的错配 DNA复制的错配率约1/1010 复制错误还表现为片段的缺失或插入。 特别是DNA上的短片段重复序列,在真核细胞染色体上广泛分布,导致DNA复制系统工作时可能出现“打滑”现象,使得新生成的DNA上的重复序列拷贝数发生变化。 DNA自身的不稳定性 : DNA结构自身的不稳定性是DNA自发性损伤中最频繁和最重要的因素。 当DNA受热或所处环境的pH值发生改变时, DNA分子上连接碱基和核糖之间的糖苷键可自发发生水解,导致碱基的丢失或脱落,其中以脱嘌呤最为普遍。 含有氨基的碱基还可能自发脱氨基反应,转变为另一种碱基,即碱基的转变,如C转变为U,A转变为I(次黄嘌呤)等。 (二)体外因素 物理因素 化学因素 生物因素 物理因素:电离辐射、紫外线(ultra violet, UV) 化学因素: 自由基导致的DNA损伤 碱基类似物导致的DNA损伤 碱基修饰剂、烷化剂导致的DNA损伤 嵌入性染料导致的DNA损伤 物理和化学因素对DNA的损伤 二、DNA损伤有多种类型 碱基脱落 碱基结构破坏 嘧啶二聚体形成 DNA单链或双链断裂 DNA交联 碱基损伤与糖基破坏: 化学毒物可通过对碱基的某些基团进行修饰而改变碱基的性质。 由于碱基损伤或糖基破坏,在DNA链上可能形成一些不稳定点,最终可导致DNA链的断裂。 碱基之间发生错配 : 碱基类似物的掺入、碱基修饰剂的作用可改变碱基的性质,导致DNA序列中的错误配对。 在正常的DNA复制过程中,存在着一定比例的自发碱基错配。 最常见的是组成RNA的尿嘧啶替代胸腺嘧啶掺入到DNA分子中。 DNA链发生断裂: 电离辐射、化学毒剂、磷酸二酯键的断裂、脱氧戊糖的破坏、碱基的损伤和脱落都是引起DNA断裂的原因。 碱基损伤或糖基破坏可引起DNA双螺旋局部变性,形成酶敏感性位点,特异的核酸内切酶能识别并切割这样的部位,造成链断裂。 DNA链上被损伤的碱基也可以被另一种特异的DNA-糖基化酶除去,形成无嘌呤嘧啶位点(apurinic-apyrimidinic site, AP site),或称无碱基位点(abasic site),这些位点在内切酶等的作用下可形成链断裂。 DNA 的共价交联: DNA双螺旋链中的一条链上的碱基与另一条链上的碱基以共价键结合,称为DNA链间交联(DNA interstrand cross-linking)。 DNA分子中同一条链中的两个碱基以共价键结合,称为DNA链内交联(DNA intrastrand cross-linking)。 DNA分子还可与蛋白质以共价键结合,称为DNA-蛋白质交联(DNA protein cross-linking)。 DNA损伤可导致 碱基置换 缺失 插入 链的断裂 转换 颠换 DNA损伤的修复 The repair of DNA damage 第二节 DNA修复(DNA repair)是指纠正DNA两条单链间错配的碱基、清除DNA链上受损的碱基或糖基、恢复DNA的正常结构的过程。 DNA修复是机体维持DNA结构的完整性与稳定性,保证生命延续和物种稳定的重要环节。 常见的DNA损伤修复途径 修复途径 修复对象 参与修复的酶或蛋白 光复活修复 嘧啶二聚体 光复活酶 碱基切除修复 受损的碱基 DNA糖基化酶、无嘌
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