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第十章 复制总结
复制的基本规律
⑴半保留复制 子代双链DNA中一条链为母体链,另一条链为新合成的,通过氯化铯(CsCl)密度梯度离心实验得到验证。
⑵有特定的复制起始点 原核生物:1个复制起始点 单复制子
真核生物:多个复制起始点 多复制子
⑶方向性 新链的合成都是5’ 3’
⑷双向复制 从复制起始点向两个方向解链,形成两个复制叉,复制向两个方向同时进行
⑸半不连续复制 沿一个复制叉方向看,以3’ 5’方向的母链为模板时,其互补链的合成顺解链方向连续合成,先复制,故称为领头链或前导链;以5’ 3’方向的母链为模板时,其互补链的合成与解链方向相反,后复制,故称为随从链或滞后链。
复制所需要的物质
一、底物(原料)
dNTP:dATP、 dGTP、 dCTP、 dTTP
基本化学反应:(dNMP)n+dNTP (dNMP)n+1+ppi
二、解旋酶
原核生物:DnaB(解旋酶)DnaA蛋白识别复制起始点,DnaB蛋白在DnaC协助下结合解旋
真核生物:DNA-polδ
三、SSB
结合在解开的单链上,其结合具有协同效应,结合-脱离-结合-脱离……………
作用:①维持模板处于单链状态 ②保护单链完整
四、引物酶 催化引物生成,引物末端留有3’-OH
原核生物:DnaG蛋白 催化生成RNA引物
真核生物:DNA-polα 催化生成RNA引物,引物中还包括一小段DNA
五、DNA 聚合酶(DNA-pol)
原核生物
DNA-polⅠ
①5’-3’聚合活性,主要用于充填短片段间间隙的作用。
②3’-5’核酸外切酶活性,切掉错误配对碱基,置换一正确碱基,称为校读作用(高保真复制机制)
③5’-3’ 核酸外切酶活性,切除引物或突变片段
用特异的酶如木瓜蛋白酶可将其水解为两部分,小片段(323aa)保留有5’-3’ 核酸外切酶活性,Klenow大片段,保留有5’-3’聚合活性和3’-5’核酸外切酶活性。
DNA-polⅡ 主要用于应急修复
①5’-3’聚合活性 ②3’-5’核酸外切酶活性
DNA-polⅢ是复制中主要起聚合作用的酶,α、ε、θ共同构成核心酶
①α亚基具有5’-3’聚合活性
②ε亚基具有3’-5’核酸外切酶活性
③ε亚基具有碱基选择功能(高保真复制机制)
真核生物 DNA-polα、β、γ、δ、ε
DNA-polδ复制中主要起聚合作用的酶
附:高保真性复制还依赖碱基配对原则
六、拓扑异构酶
理顺DNA链,使正超螺旋变为负超螺旋,易于解旋酶解链
作用过程:①切断磷酸二酯键 ②松解超螺旋 ③连接
七、连接酶
连接碱基互补基础上的双链中的单链缺口,形成磷酸二酯键。
复制过程
原核生物
一、起始
起始点保守序列:3组串联重复序列,两对反向重复序列,均富含A、T。
DnaA蛋白识别并结合在富含A、T的两对反向重复序列上,DnaB蛋白在DnaC蛋白协助下结合在DNA链上并促使其解链,并不断置换掉DnaA蛋白,然后SSB结合在解开的单链上使其保持单链状态,为下一步复制提供模板,引物酶DnaG蛋白进入,在适当的位置以解开的DNA链为模板合成一小段RNA引物,引物合成完成后,留有游离的3’-OH末端,为DNA复制进入延长阶段做好准备。
二、延长
顺复制叉方向看,当模板为3’-5’时,其新链可在引物基础上由聚合酶连续地沿复制叉方向合成,而另一条模板链的新链则等链解开一段后,沿与解链方向相反的方向分段合成。解螺旋酶向两个方向继续解链,不断解开双链,随着解链的进行,复制叉前方变为正超螺旋,使解螺旋酶难以继续解链,因此拓扑异构酶松解超螺旋,正超螺旋变为负超螺旋,使解链可以继续进行。
三、终止
包括切除引物(RNA酶或DNA-polⅠ)、充填引物切除后所形成的空隙(DNA-polⅠ)、DNA连接酶最后连接成完整的链。
真核生物最后还要在两端合成称为端粒的结构。
第四节、逆转录
RNA逆转录酶 RNA-DNA 逆转录酶 DNA 逆转录酶 DNA-DNA
第五节、DNA损伤与修复
突变类型:错配、缺失、插入、重排
缺失、插入可导致框移突变。
修复机制:直接修复、切除修复(最重要的修复机制)、重组修复、SOS修复
切除修复过程:识别损伤部位-切除损伤部位-填补空隙-连接
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