中国樱桃泰山干樱S-RNase基因的克隆及序列分析.pdfVIP

果 树 学 报 2008，25(3)：332-337 JournalofFruitScience 中国樱桃泰山干樱 S-RNase基因 的克隆及序列分析 吴 俊 ，李 晓 ，张绍铃 ，刘庆忠 (南京农业大学园艺学院，南京 210095；山东省果树研究所 ，山东泰安 271000) 摘 要 ：以中国樱桃品种泰 山干樱为试材 。利用李属植物 C2、C5保守区引物 ，扩增花柱 S—RNa~e基 冈，获得4个 S 等位基因，测序结果表明序列大小分别为 ：1608、950、796、504bp。根据 同源 比较发现大小为 796bp的等位基 因与基 因库中登录的Jsj-RNase为 同一基 因．其它 3个 Js Nase基因为首次报道 。依序列大小分别命名为 s2(1608bp，登 陆号 EF541168)、$4(950bp，登陆号EF541173)和 Js6(540 bp，登陆号 EF54¨72)。序列分析表明Js2一剐V∞e在 C3区 存在终止密码子 ，导致翻译提早终止 ；Js一R№ e的C5区前有插入片断；S6-RNase在高变区比其它 S等位基因少一 个氨基酸残基 。氨基酸序列 同源性 比较分析表明，中国樱桃 S—RNase与樱花、扁桃 的相似性高。在系统进化树 中中国 樱桃的4个 S—RNase基因的氨基酸序列和樱花、扁桃 、甜樱桃、酸樱桃等一起归于李亚科 。 关键词：中国樱桃；自交亲和 ；S—R№ e；序列 ；系统树 中图分类号：S662．5 文献标识码：A 文章编号：1009—9980(2008)03—332—06 Cloningand sequenceanalysisofS-RNase genein tetraploid Chinese cherryofTaishanganying(Prunuspseudocerasus) WUJun，LIXiao，ZHANGShao—ling ，LIUQing-zhong2 (CollegeofHorticulture，NanjingAgriculturalUniversity，Nanjing，jiangsu210095China；2ShandongFruitResearchInstitute，Taian，Shah— dorrg271000Chi~) Abstract：Fourspecificfragmentswereisolatedfrom ChinesecherryTaishanganyingwithconservedC2andC5primerin Prunusbyallele-specialPCR．Theresultsofsequencingshowedthattheyencoded1608，950，796，540 bp，respectively． BlastnresearchshowedthatoneS-RNaseof796bpwasidenticaltoS1-RNasegene，theotherthreeS-RNasegeneswere reportedfirstly．WesubmittedhtreenewS-RNasegenestotheGenbankanddenotedhtemasJs2 (1608bp，accessionnun- berEF541168)，Js (950bp，accessionnumberEF541173)，andJs6 (540 bp，accessionnumberEF541172)．Terminate codon，whichleadingtranslationstopahead，wasfoundinC3regionofJs2一RNase；fragmentinsertlocatedbeforetheC5re— gionofS4-RNaseandoneaminoaciddeletedinRHV regionofS6-RNaseaccodingtohteanalysisofaminoacidsequences． FourS-RNasesofChinesecherryrevealedhighersequenceidentitieswithJapanesefloweringcherryand