第五章 BrainNet Viewer Guide 使用范例.pdf

BrainNet Viewer 工作流程： 可分成四部分：读入文件、设置绘图格式、网络显示和结果导出。 BrainNet Viewer 定义4 中可读入的文件： 1)脑曲面文件 （Brain surface files）：ASCII 文件，后缀名为 “nv”，包含了 脑曲面的上的顶点和三角面片信息。  2)节点文件 （node files）：ASCII 文件，后缀名为 “node”，为n 6 的矩阵， 包含了节点的坐标、颜色、大小和标签信息  3)边文件 （edge files）：ASCII 文件，后缀名为 “edge”，为n n 的矩阵，即 节点间的相关矩阵 4)三维图像文件（volume files）：NIFTI或Analyze 格式，后缀名为配对的“hdr” 和 “img”该文件仅用于体素到曲面的映射绘制. 主要功能： （ 1）脑网络的多视角显示 （2 ）显示多种由脑曲面，节点和边构成的不同组合 （3）多种方式调节节点的颜色和大小 （4）多种方式调整边的颜色和大小 （5）自定阀值来提取相关矩阵中的边信息 （6）实现体素图像到曲面的映射 （7）支持输出常用的包括TI 、BMP、JPEG、PNS 和EPS 五种格式图片 （8）支持输出图片尺寸和分辨率的调整 （9）可进行放大和缩小，旋转等交互式操作 功能和使用： (1)Installation 打开matlab，把BrainNet Viewer 添加当前路径 （注意全是英文路径， 否则出现读取错误），在matlab 工作区内输入BrainNet 即打开如下图片： Fig 1.BrainNet Viewer 界面 （2 ）picture：产生的组合图片。（提供参考） Fig.2 各种组合 （3）Load Files 点击File-Load File 出现以下图片： Fig.3 加载界面 1.点击Browse （Surface file）选择.\Data\SurfTemplate\BrainMesh_ICBM152.nv (BrainNet Viewer 提供2 中不同类型的大脑模板CH2\ICBM152,根据自己所需，选择 不同模板) 2.点击Browse （node）选择.\Data\ExampleFiles\AAL90\Node_AAL90.node(可以 选择不同节点模板，一共提供ALL90、Brodmann82、Custom、Dos160、Fair34、 HOA112、LPBA40，在这其中进行选择) 3.点击Browse（edge）选择.\Data\ExampleFile\AAL90\Edge_AAL90_Binary.edge 4.点击Browse （volume）选择双样本t 检验结果。点击OK： （4）Visualize option 1Layoutpanel （如下图）