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第 21 卷第 17 期 系 统 仿 真 学 报© Vol. 21 No. 17
2009 年 9 月 Journal of System Simulation Sep., 2009
生物网络及其一些进展
1,2 1,3
张嗣瀛 ,张 晓
(1.青岛大学复杂性科学研究所,青岛 266071 ;2.东北大学信息科学与工程学院,沈阳 110004 ;
3.乌布萨拉大学医学院,乌布萨拉 瑞典)
摘 要:DNA 双螺旋结构模型的提出,使得对生物学的认识进入到分子水平,开始了分子生物学
的时代,并一直持续了半个世纪。当前,生物学的研究已进入后基因组时代,其特点是:从整体或
系统的水平上去认识生物体,并诞生了系统生物学。生物系统是一种复杂系统。复杂系统的一个显
著特点是多个参与者密切相互作用。复杂网络是描述复杂系统的一种有力工具,系统中的参与者可
表示为网络中的点,相互作用可表示为网络中的连线。这样,复杂网络也可作为分析生物系统的一
种工具,例如新陈代谢过程,参与作用的“底物”及其相互作用可用复杂网络描述。生物网络的研
究已约有十年的历史,给出一简要综述,介绍它的一些进展,包括代谢网及其大尺度组织,无标度
拓扑,分层等级模块结构,网络鲁棒性,自相似性及分形结构等等。
关键词:后基因组生物学;系统生物学;生物网络;复杂网络;复杂系统
中图分类号:N94 文献标识码:A 文章编号:1004-731X (2009) 17-5300-06
Biological Networks and Some of Their Developments
ZHANG Si-ying 1,2, ZHANG Xiao3
(1. Institute of Complexity Science, Qingdao University, Qingdao 266071, China;
2. School of Information Science and Engineering, Northeastern University, Shenyang 110004, China;
3. Faculty of Medicine, Uppsala University, Uppsala, Sweden)
Abstract: The presentation of the DNA double helix model led to that the understanding of biology got into the molecular
level. Then the era of molecular biology began. This era sustained about half century. Now, the researches of biology are at
the post-genomic era, in which the biological systems are studied at the ensemble- or system-level and the systems biology
emerges. Biological systems are
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