土壤病毒生态学研究方法.PDFVIP

第 ３７ 卷第 ６ 期 生 态 学 报 Ｖｏｌ．３７，Ｎｏ．６ ２０１７年３月 ＡＣＴＡ ＥＣＯＬＯＧＩＣＡ ＳＩＮＩＣＡ Ｍａｒ．，２０１７ ＤＯＩ：１０．５８４６／ ｓｔｘｂ２０１５１１１２２２９２ 韩丽丽，于丹婷，贺纪正．土壤病毒生态学研究方法．生态学报，２０１７，３７（６）：１７４９⁃１７５６． Ｈａｎ Ｌ Ｌ，Ｙｕ ＤＴ，ＨｅＪ Ｚ．Ｒｅｓｅａｒｃｈ ｍｅｔｈｏｄｓｆｏｒ ｓｏｉｌ ｖｉｒａｌ ｅｃｏｌｏｇｙ．Ａｃｔａ Ｅｃｏｌｏｇｉｃａ Ｓｉｎｉｃａ，２０１７，３７（６）：１７４９⁃１７５６． 土壤病毒生态学研究方法 １ １，２ １，∗ 韩丽丽 ，于丹婷 ，贺纪正 １ 中国科学院生态环境研究中心，城市与区域生态国家重点实验室，北京　 １０００８５ ２ 中国科学院大学，北京　 １０００４９ 摘要：病毒是地球上最丰富的生物实体，每克土壤中可包含数以亿计的病毒，它不仅影响土壤中其它微生物的群落组成、土壤元 素的生物地球化学循环，还会影响土壤微生物的物种进化，甚至影响植物、动物和人体健康。 目前人们对土壤中病毒的种类及 丰度、分布特征以及功能引起的生态环境效应还知之甚少。 在概述病毒生态学研究方法的基础上，对土壤病毒的提取、纯化、定 量及分子生态学方法等基本流程进行了比较分析，以期建立一套快速简便、高效稳定的适用于土壤病毒研究的方法，并用于研 究土壤病毒的多样性及分布特征，探讨病毒在环境中的生存和传播机制，为土壤病毒的防控及开发利用提供支撑。 关键词：土壤病毒；病毒生态学；宏病毒组学；分子生物学方法 Ｒｅｓｅａｒｃｈ ｍｅｔｈｏｄｓ ｆｏｒ ｓｏｉｌ ｖｉｒａｌ ｅｃｏｌｏｇｙ １ １，２ １，∗ ＨＡＮ Ｌｉｌｉ ，ＹＵ Ｄａｎｔｉｎｇ ，ＨＥ Ｊｉｚｈｅｎｇ １Ｓｔａｔｅ Ｋｅｙ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｏｆ Ｕｒｂａｎ ａｎｄ Ｒｅｇｉｏｎａｌ Ｅｃｏｌｏｇｙ， Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ｅｃｏ⁃Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ， Ｃｈｉｎｅｓｅ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ， Ｂｅｉｊｉｎｇ １０００８５，Ｃｈｉｎａ ２ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ ＣｈｉｎｅｓｅＡｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｂｅｉｊｉｎｇ １０００４９，Ｃｈｉｎａ １０ Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｖｉｒｕｓｅｓ ａｒｅ ｔｈｅ ｍｏｓｔ ａｂｕｎｄａｎｔ ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ ｅｎｔｉｔｉｅｓ ｏｎ ｔｈｅ ｐｌａｎｅｔ，ａｎｄ ｃａｎ ｒｅａｃｈ １０ ｖｉｒａｌ ｐａｒｔｉｃｌｅｓ ｐｅｒ ｇｒａｍ ｏｆ ｓｏｉｌ． Ｖｉｒｕｓｅｓ ａｆｆｅｃｔ ｔｈｅ ｃｏｍｐｏｓｉｔｉｏｎ ｏｆ ｍｉｃｒｏｂｉａｌ ｃｏｍｍｕｎｉｔｉｅｓ，ｍｅｄｉａｔｅ ｓｏｉｌ ｂｉｏｇｅｏｃｈｅｍｉｃａｌ ｃｙｃｌｅｓ，ｒｅｇｕｌａｔｅ ｓｏｉｌ ｍｉｃｒｏｂｉａｌ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ，ａｎｄ ｔｈｒｅａｔｅｎ ｔｈｅ ｈｅａｌｔｈ ｏｆ ｐｌａｎｔｓ ａｎｄ ａｎｉｍａｌｓ，ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ ｈｕｍａｎｓ． Ｈｏｗｅｖｅｒ，ｔｈｅｒｅ ｉｓ ｌｉｍｉｔｅｄ ｋｎｏｗｌｅｄｇｅ ｏｎ ｔｈｅ ａｂｕｎｄａｎｃｅ ａｎｄ ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ ｐａｔｔｅｒｎｓ ｏｆ ｖｉｒｕｓｅｓ ａｎｄ ｔｈｅ ｍａｎｎｅｒ ｉｎ ｗｈｉｃｈ ｔｈｅｙ ａｆｆｅｃｔ ｅｃｏｌｏｇｉｃａｌ ｐｒｏｃｅｓｓｅｓ． Ｔｈｉｓ ｓｔｕｄｙ ｆｏｃｕｓｅｓ ｏｎ ｔｈｅ ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ ａｐｐｒｏａｃｈｅｓ ｔｏ ｓｔｕｄｙ ｓｏｉｌ ｖｉｒｕｓｅｓ，ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ ｔｈｅｉｒ ｅｘｔｒａｃｔｉｏｎ，ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ，ｑｕａｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ，ａｎｄ ｍｅｔｈｏｄｓ ｐｅｒｔａｉｎｉｎｇ ｔｏ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｅｃｏｌｏｇｙ． Ｔｈｅ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ｏｆ ｒｅｌｉａｂｌｅ ａｎｄ ｈｉｇｈｌｙ ｅｆｆｉｃｉｅｎｔ ｍｅｔｈｏｄｓ ｔｏ ｅｖａｌｕ