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分子生物学课件-1-染色体与dna
2 染色体与 DNA 2.1 染色体 2.1.1 染色体概述 2.1.2 真核细胞染色体的组成 染色体特征:分子结构相对稳定;能够自我复制,使亲子代之间保持连续性;指导蛋白质的合成,控制整个生命过程;产生可遗传的变异。 真核细胞DNA的转录和翻译在不同的空间和时间上进行,其基因表达的调控不仅与DNA序列有关,也与染色体的结构有关。 非组蛋白 包括酶类和细胞分裂有关的蛋白(收缩蛋白、骨架蛋白、核孔复合物蛋白、肌动蛋白、肌球蛋白、微管蛋白、原肌蛋白) 高速泳动蛋白(high mobility group protein, HMG蛋白)能与DNA结合,也能与H1作用,可能与超螺旋结构有关。 DNA结合蛋白 可能是一些与DNA复制或转录有关的酶或调解物质。 A24非组蛋白 C端与H2A相同,功能不详 3. 染色质、染色体的组装 核小体——染色体DNA的一级包装 染色质螺线管(30nm fiber)——二级包装 染色质纤维环—三级包装 染色质的电子显微镜图和X线衍射图 微球菌核酸酶(Micrococcal nuclease) 染色质后电泳,被保留的DNA片段均为200bp基本单位的倍数。 核小体单体被微球菌核酸酶处理后,随着时间延长,其降解产物(DNA片段)会逐渐缩短,从200bp降至146bp,至此很难再进一步降解。 这种稳定结构为核心颗粒,它是由147bp的DNA片段和H2A、H2B、H3和H4各2分子组成。 染色质螺线管(30nm fiber) 在较高离子强度下,并保留H1,电镜可观察到10nm纤维会折转成较粗的30nm纤维,这就是染色体DNA的二级包装——螺线管纤维(solenoidal fiber)。 螺线管纤维(的形成使DNA一级包装又压缩了6倍。 是分裂间期染色质和分裂中期染色体的基本组分。 螺线管纤维缠绕在非组蛋白构成的中心轴(central axis)骨架(支架蛋白质)上形成染色质纤维环。 染色质纤维环是在螺线管纤维基础上的更高一级包装。 从螺线管纤维环到包装形成染色体是DNA压缩程度最高的阶段,估计在200~240倍。 纤维环的形成是基因表达较理想的结构,这些环状区是基因表达的活性单位所在。因为纤维环DNA比其它区域有更伸展的结构。 染色体(chromosome)的形成 染色质浓缩时,纤维环会再绕成直径600nm的螺旋。若用染料染色,即呈现观察到的染色体。 这种更高层次上的组装机理,目前尚无明确定论。 真核生物基因组的结构特点 基因组庞大 存在大量重复序列 大部分为非编码序列(90%) 真核生物与细菌、病毒最主要区别 转录产物为单顺反子(见P452页解释) 真核基因是断裂基因,有内含子 存在大量顺式作用元件(启动子、增强子、沉默子) 存在大量的DNA多态性 有端粒结构 2.1.3 原核生物基因组 2.2 DNA的结构 DNA的方向是5’-3’(蛋白质是N-C) DNA通常以线性或环状形式存在 DNA通常是双链的(dsDNA),少数是单链的(ssDNA) DNA的一级结构是指4种核苷酸的排列顺序。 线条式: 在碱基符号书写基础上,以垂线(位于碱基之下)和斜线(位于垂线与P之间)分别表示糖基和磷酸酯键。 2.2.2 DNA的二级结构 DNA不仅具有严格的化学组成,还具有特殊的空间结构,主要以有规则的双螺旋形式存在。 Z-DNA的生物学意义 Z-DNA的形成通常在热力学上是不利的。因为Z-DNA中带负电荷的磷酸根距离太近了,这会产物静电排斥。但DNA链的局部不稳定区的存在就成为潜在的解链位点。DNA解螺旋却是DNA复制和转录等过程中必要的环节,因此认为这一结构位点与基因调节有关。 可能提供某些调节蛋白的识别位点。 超螺旋是双螺旋DNA进一步扭曲盘绕形成的三级结构。 (1)超螺旋(superhelix or supercoil)的发现 1965年电镜发现SV40和多瘤病毒的环形DNA的超螺旋; 绝大多数原核生物DNA都是共价封闭环(covalently closed circle DNA, ccc DNA)分子, 双螺旋环状分子螺旋化成为超螺旋结构。 有些单链环形染色体(如φ×174)或双链线形染色体(如噬菌体?),在其生活周期的某一阶段,染色体也变为超螺旋结构。 真核生物的染色体多为线形分子,但DNA均与蛋白质相结合,同样具有超螺旋形式。 (2) 超螺旋的形成 DNA双螺旋结构中,一般每转一圈有10个核苷酸对,平时,双螺旋总处于能量最低状态。 若正常DNA双螺旋额外地多转或少转几圈,使每一圈的核苷酸数目大于或小于10,就会出现双螺旋空间结构的改变,在DNA分子中产生额外张力。 若此时双螺旋的末端是固定的或是环状分子,双链不能自由转动,额外的张力不能释放,导致D
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