SmartChip超高通量定量PCR系统简介中文.pdfVIP

SmartChip超级通量荧光定量PCR系统 SmartChip超级通量荧光定量PCR系统是美国WaferGen Biosystems公司推出的一款 高通量、高密度、纳升级别的实时定量PCR系统。该系统包括一台纳升级多样品自动 加样器、高密度实时定量 PCR仪及分析软件，可广泛应用于基因表达定量、基因分型 等研究领域。 SmartChipreal-timePCRsystem平台优势：  高通量 一张SmartChip包含5184个微孔，一次运行可同时完成多达5184个独立的扩增反应。  低起始 只需500ng总核酸样品 ，单孔样品用量低至100pg即可完成扩增反应，大量节省样品 的投入，尤其是珍贵样品的投入。  低成本 单个孔反应体积仅100nL，传统QPCR反应体系多为 10μL~50μL，比传统QPCR节省 试剂、引物用量高达80%以上。  周期短 平均2小时即可完成40cycle的QPCR反应 ，大大缩短项目周期，推进项目进展。  简单灵活工作流程 两种 ： 和 。 SmartChip panel PredispenedSmartChip Panel SmartChip MyDesignChips PredispenedSmartChip Panel里面已经含有的PCR引物/探针 ，用户只需要将样品及 试剂通过加样器加到芯片中即可；SmartChip MyDesignChips不包含PCR引物/探针， 用户自行加入样品、试剂和PCR引物/探针。 图1 SmartChip实时定量PCR系统在一个整合平台上提供了极佳的灵活性：无论是单个样品成千个位点， 多个样品数十个到数百个位点，还是成百个样品多个位点，都可以轻松完成实验。简单的、自动化的，两 小时快速流程，准确的、低成本的表达谱及基因分型方案。  多种应用 SmartChip实时定量PCR系统是一个潜在的多功能技术平台，结合高通量测序技术和 深入的信息分析，该平台可以为基因功能、致病机理、环境研究及单细胞分析等提供 更广阔的思路。 SmartChip实时定量PCR系统： 1. SmartChip 此芯片是一个包含5184个孔的纳米孔阵列（72×72），每个孔的反应体系为100nL。 2. 纳升级多样品自动加样器（SmartChip MultisampleNanodispenser,MSND） MSND是一款纳升级自动移液设备，可以将384孔板里的样品或试剂转移至 SmartChip中，转移液体体积为纳升级别。 3. 高密度实时定量PCR（SmartChipcycler） 是 推出的一款高密度实时定量 仪，用来运行和分析 SmartChipcycler WaferGen PCR SmartChip中的QPCR反应，两小时即可获得研究人员想要的高质量QPCR扩增数据。 SmartChip实时定量PCR系统性能表现： 灵敏度 10-20copiesof DNA 特异性 可辨别相似度90%的同源基因 精确度 重复样品间标准偏差 0.2Ct 2 重现性 芯片间R 0.95或 4%CV 1 2 表 1在多个SmartChip实时定量PCR系统中SmartChip MyDesign芯片和predispensedSmartChip基因分 型panel均能产生高检出率，高均一性以及重复性极高的结果。图2 MyDesign芯片中运行的样品与 predispensedSmartChip基因表达panel中运行的样品获得的mRNA表达水平一致。一个基因集合里的 96个基因选取5个通过5个连续的倍比稀释实验后得到，浓度从0.025ng/孔到0.4ng/孔，两者的线性相 2 关系数R 0.99。 图3(A)SmartChip MyDesig