代谢组学样品处理.docxVIP

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代谢组学样品处理

血液的采集:采血前4h勿喝茶或咖啡,勿吸烟饮酒。尽量了解患者对刺激物(烟、酒、咖啡)和成瘾药物的接触史,供评价结果时参考。采集时间:一般在早晨6-9时采集;采血前患者应禁食6h以上;采血尽量安排在其他检查治疗前进行。尿样的采集:女性患者避免在月经期留取标本,防止混人阴道分泌物,必要时冲洗外阴后留取中段尿检查;新生儿收集尿标本时,应注意冲洗会阴部或采取特殊留尿方式;标本留取后应立即送检。随机尿:即留取任何时间的尿液,用于门诊患者;晨尿:收集早上起床后第一次尿液,此标本适合住院患者的尿液检查;餐后尿:通常在餐后2h收集尿液,此标本对于病理性蛋白尿、糖尿更为敏感;24 h尿:第一天上午8时排空膀胱,再收集以后24 h内所有的尿液标本。NMR样品处理血样处理:用含有肝素钠抗凝的采血管采血,室温下1500r/min低速离心10min,去除全血中血细胞等大分子物质。离心后用移液枪吸取上清(血浆)放入EP管内,进行第二次离心(4℃,20000r/min,10min)以去除血浆中的杂质,保留血浆中的小分子代谢物。离心后吸取上清液放入干净的EP管中,进行样品的冻干处理,然后保存在-20℃低温冰箱中备用。NMR数据采集时,将冻干处理的血浆样品在室温下解冻,将450ul解冻样本移入干净的核磁管内,以1:10的比例缓慢加入重水值500ul,50ul 1%TSP水溶液,混匀,静置5min。样品处理完成后就可直接在核磁共振仪上进行光谱采集。尿样处理:收集尿样的管中加入0.1%的NaN3水溶液作为防腐剂,样品保存在-75℃冰箱中直到NMR测试。NMR测试一般需要300-400ul尿样。从冰箱中取出尿样解冻后,每个样品取400ul,加入200ul重水配置的磷酸盐缓冲液(0.2mol/L:NaHPO4/NaH2PO4;PH7.4含3mmol/LTSP)混合静置10min;离心13000rpm,10min后取500ul进行NMR测试。GC-MS,LC-MS样品处理血样处理:GC-MS:用含有肝素钠抗凝的采血管采血,室温下1500r/min低速离心10min,去除全血中血细胞等大分子物质。离心后用移液枪吸取上清(血浆)放入EP管内。取100ul血浆,用900ul的甲醇水(8:1v/v)溶液(包含全部内标物)萃取。离心4℃,8000rpm,10min)。取上清200ul蒸干。在做GC-MS之前用30ul甲氧胺(15mg/l)吡啶溶液衍生16h,之后MSTFA衍生1h。之后即可进行GC-MS试验(如物质浓度过高超过检测线可用乙腈稀释)。LC-MS:方法同上,不需要后面的衍生步骤。将蒸干的残留物根据不同的目的用乙酸乙酯等溶液溶解,然后进行LC-MS试验。尿样处理:GC-MS:收集尿样,立刻离心去沉淀,-80℃保存备用。制样时,将尿样在室温溶解3000rpm/min离心10min。取600ul上清液加入内标物,加入400ul无水乙醇,100ul吡啶,50ulECF(Ethyl chloroformate)。40KHZ超声60s。衍生,然后用300ul氯仿抽提,用NaOH(7mol/l)调节水相PH到9-10。在上述溶液中在加入50ulECP再次衍生,漩涡混合30s,1900g离心10min,吹干水相,得到的氯仿相用无水硫酸钠干燥,然后就可以进行GC-MS试验了。LC-MS:收集尿样,立刻离心去沉淀,-80℃保存备用。制样时,将尿样在室温溶解3000rpm/min离心10min。取上清液,用等体积的乙酸乙酯抽提,水层用等体积的己烷洗,五十分之一体积的1M盐酸酸化,然后再用等体积的乙酸乙酯抽提,有机相离心蒸发,残留物用流动相溶解做LC-MS实验。

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