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片段分析的常见故障排除
片段分析的常见故障排除
Field Application Scientist
Tel :800 820 8982/400 820 8982
E-mail: cntechsupport@
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1
高质量的片段分析数据
•峰形正常,合适峰高(峰高+峰形)
•正确确定峰的大小(Sizing Quality + Size Curve)
• 基因分型结果准确(Allele Calling)
• 结果重现性好
2
信号强度
• 信号强度是峰检测的一个重要标准
• 常见问题
• 信号太低或没有信号
• 信号太高
• 信号不均匀或逐渐下降
• 症状
• 某个峰未被检测到
• 某个峰未被正确检测(被检测为多个峰)
3
信号过低
• 症状
• 低峰高
• 通过分析软件不能检测到峰
• 原因
• 信号弱或没有扩增
• 模板质量、浓度、PCR抑制
• PCR仪故障
• PCR试剂问题
• 电泳前PCR产物过度稀释
• PCR产物浓度低或没有进样
• 孔里没有样品
• 孔里有气泡
• 自动取样器校准
• 激光问题
• 电泳
4
PCR 抑制
• 样品 •提取
• 血色素 • 氯仿
• 肝磷脂 • 苯酚
• 多酚(植物样品) • EDTA
• 多聚糖 • 清洁剂(SDS)
• 二甲苯
• 酒精
• 溴苯酚蓝
设置一个阳性PCR对照 !
5
信号过低
Peak Heights ~ 40-180 rfus
6
样品和内标信号不平衡
Sample : Size Standard = 3 : 1
7
信号过高
• 症状
• Pull up峰
• Pull-down峰
• Wide or flat-topped峰
• 原因
• 样品进样过多(样品没有充分稀释)
• 反应中模板过量
* 其他影响进样的因素
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