胺基酸序列决定三级结构.PPT

p.149 第二類分子伴護稱為伴護蛋白（chaperonins）。 未摺疊蛋白質會結合在 GroEL 複合體內部的口袋中，而此口袋會被 GroES「蓋子」暫時蓋住（圖 4-30）。 最後，有些蛋白質的摺疊途徑需要兩種催化異構化反應的酵素參與： 　1. 蛋白質雙硫異構酶（PDI） 　2.胜肽脯胺酸順-反異構酶（PPI） p.150 圖4-30(a) p.150 圖4-30　蛋白質摺疊過程中之伴護蛋白。(a) 大腸桿菌伴護蛋白 GroEL（Hsp60 蛋白質家族的一員）與 GroES 作用的假設途徑。每個 GroEL 複合體含有由兩個七聚體環（每個次單元體的相對分子量是 57,000）形成的兩個大口袋。GroES也是七聚體（次單元體相對分子量為 10,000），會封阻其中一個 GroEL 口袋。 圖4-30(續) p.149 蛋白質摺疊缺陷可能是大範圍的人類基因失調之分子基礎 很多的疾病產生來自常見的蛋白質錯誤摺疊的機制，包括第二型糖尿病，阿滋海默症、亨丁頓舞蹈症和帕金森氏症。 在大部分的案例中，一個可溶性蛋白質可在細胞內被正常地分泌出來，卻在一個錯誤摺疊的狀態下被分泌而且被轉換成不可溶的胞外澱粉狀（amyloid）蛋白纖維。 這些疾病被通稱為澱粉樣貯積症（amyloidoses）。 p.151 圖4-31(a) 圖4-31　疾病發生的澱粉狀蛋白纖維形成。(a) 有正常結構的蛋白質分子，包括處於部分摺疊的 β 摺板區域。一小部分的蛋白質分子，在摺疊完成前，一個多肽的 β-摺板區域會和位於另一個多肽的相同 β 摺板區域結合，形成一個澱粉狀蛋白的核心。額外的蛋白質分子會慢慢地和澱粉狀蛋白結合，然後擴展以形成一個纖維。 p.151 圖4-31(b) 圖4-31　疾病發生的澱粉狀蛋白纖維形成。 (b) 在阿滋海默症中，扮演重要的角色的澱粉狀-β 胜肽，是衍生自一個較大的穿膜蛋白，稱為澱粉狀-β 前驅蛋白或是 APP。這個蛋白質被發現存在於大部分的人體組織中。當它還是大型內膜蛋白的一部分時，它是一個帶有二個嵌在膜上的 α-螺旋區段的胜肽。當它外部和內部的區域被特定的蛋白酶（protease）裁切掉時，剩下來而且相當不穩定的澱粉狀-β 胜肽會離開細胞膜並且失去它的α-螺旋構形。然後它會被慢慢地組成至澱粉狀蛋白纖維中。 p.151 圖4-31(c) 圖4-31　疾病發生的澱粉狀蛋白纖維形成。 (c) 然後會促使典型的塊狀物形成在阿滋海默症病人的神經組織外。澱粉狀蛋白富含 β-摺板結構，其 β 股排列會垂直於澱粉狀蛋白纖維的軸線。在澱粉狀-β 胜肽中，它的結構是採一個擴張的雙層平行 β 摺板的形態。其他的可能會採左旋 β-螺旋的形態。 BOX 1-2 FIGURE 1 p.152 BOX 4-6　摺疊錯誤造成之死亡：狂牛症 圖1　這是庫賈氏症患者的腦部皮質染色切片，呈現出海綿狀（液泡）退化性病變，這也是最顯著的神經組織學特徵。淡黃色的液泡位於細胞內，大多出現在神經元突觸的前方與後方。在此切片中液泡的大小變異為直徑 20至 100 μm。 BOX 1-2 FIGURE 1 p.152 BOX 4-6　 圖2　人類 PrP 球狀區塊之結構，左圖為單體，右圖為二聚體。第二個次單元體以灰色表示，來突顯當二聚體形成時，第一個次單元體之綠色 α 螺旋（改變為向下翻轉）會產生顯著的構形變化。 總結 4.4 蛋白質的三度空間結構與功能可被變性破壞，而顯示出結構與功能之間的關係。有些變性蛋白質可以自發地復性為具有生物活性的蛋白質，顯示蛋白質的三級結構是由胺基酸序列所決定的。 細胞中的蛋白質摺疊可能牽涉非常多途徑。開始時會先形成二級結構，接著形成超二級結構。摺疊中間產物大量組合後會迅速形成單一天然構形。 對許多蛋白質來說，摺疊需要 Hsp70 分子伴護與伴護蛋白的協助。雙硫鍵的形成與脯胺酸鍵之順反異構化需要特定酵素的催化。 蛋白質錯誤摺疊是導致許多人類疾病產生的分子基礎，澱粉樣貯積症就是一典型的例子。 p.153 p.138 第一個名詞是模體（motif），也稱為超二級結構（supersecondary structure）或簡稱摺疊（fold）。 例如：β-α-β 環（β-α-β loop 圖4-17a）。 第二個描述結構樣式的名詞為區塊（domain）。 在一個具有多區塊的蛋白質中，每個區塊會有其特定的球狀葉（圖4-18）。 p.139 圖4-17(a) 圖4-17　模體 (a) 一個簡單的模體：β-α-β 環。 p.139 圖4-17(b) 圖4-17　模體 (b) 一個比較複雜的模體：β 圓筒。β 圓筒是分離自金黃色葡萄球菌 α-溶血蛋白（衍伸自 PDB ID 7AHL，一種會在細胞膜表面打洞而造成細胞死亡的毒素）的單一結構區塊