猪THRSP基因5调控区多位点SNP联合效率的研究.PDFVIP

猪THRSP基因5调控区多位点SNP联合效率的研究.PDF

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猪THRSP基因5调控区多位点SNP联合效率的研究

安徽农业大学学报, 2014, 41(2): 278-281 Journal of Anhui Agricultural University [DOI] 10.13610/ki.1672-352x0035 网络出版时间:2014-3-12 14:05:00 [URL]/kcms/doi/10.13610/ki.1672-352x0035.html 猪 THRSP 基因 5’调控区多位点 SNP 联合效率的研究 1 1 1,2* 1 1 1 1 1 谢亚男 ,焦明慧 ,陈宏权 ,潘中婷 ,陈公伟 ,周 梅 ,王学故 ,马帮军 (1. 安徽农业大学动物科技学院,合肥 230036 ;2. 安徽畜禽遗传资源保护与生物育种省级实验室,合肥 230036) 摘 要: 旨在分析猪THRSP 基因5’调控区多位点SNP 联合调控THRSP 基因表达的效率。实验从猪基因组获 取包含多位点 SNP 的目的片段,利用荧光素酶报告基因pGL3-Basic 构建表达载体,检测多位点 SNP 的联合启动 效率,并通过实时荧光定量PCR 进行THRSP 基因表达验证分析。结果表明,在 5 个SNP 位点中,TCAGA 的启 动效率最高,比CTGGA 的启动效率高129 %,而CCAGA 、CTAGA 和CTGAT 的启动效率较CTGGA 分别低99.0%、 73.2 %和42.6 %。TCAGA 的启动效率较CCAGA 高75.6 %,而CCAGA 比CTAGA 的启动效率高96.6 %;报告基 因所揭示的SNP 启动效率与THRSP 基因实时荧光定量PCR 结果一致。 关键词:THRSP 基因;多位点SNP 联合调控;基因表达;猪;脂肪沉积 中图分类号:Q75; S81 文献标识码:A 文章编号:1672−352X (2014)02−0278−04 Study on the promoter efficiency of multi-sites SNP in 5 regulatory region of THRSP gene in pigs 1 1 1, 2 1 XIE Yanan , JIAO Minghui , CHEN Hongquan , PAN Zhongting , 1 1 1 1 CHEN Gongwei , ZHOU Mei , WANG Xuegu , MA Bangjun (1. School of Animal Science and Technology, Anhui Agricultural University, Hefei 230036; 2. Anhui Provincial Laboratory for Local Livestock and Poultry Genetic Resource Conservation and Breeding, Hefei 230036) Abstract: This paper aims to analyze the promoter efficiency of multi-sites SNP to THRSP gene expression in the 5’ regulatory region of pig THRSP gene. The fragments containing 5 SNP sites were obtained from the 5’ regulatory region in pig genome. The pGL3-Basic

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