基于密度泛函理论的细胞色素p4501a2 抑制剂的定量构效关系.pdf

第３３卷 第１期 桂 林 理 工 大 学 学 报 Ｖｏｌ３３Ｎｏ１ ２０１３年２月 ＪｏｕｒｎａｌｏｆＧｕｉｌｉｎＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ Ｆｅｂ　２０１３  文章编号：１６７４－９０５７（２０１３）０１－００９９－０８　　　　　 ｄｏｉ：１０３９６９／ｊ．ｉｓｓｎ１６７４－９０５７２０１３０１０１９ 基于密度泛函理论的细胞色素 Ｐ４５０１Ａ２ 抑制剂的定量构效关系 易忠胜，叶廷文，刘红艳，莫凌云 （桂林理工大学 化学与生物工程学院，广西 桂林　５４１００４）  摘　要：在Ｂ３ＬＹＰ／６－３１Ｇ 水平上采用高斯０９全优化计算了５０个Ｐ４５０１Ａ２抑制剂的量子化学参数， 应用基于预测的模型变量选择方法（ＶＳＭＰ）选择描述子最佳子集，建立了最高轨道占有能（Ｅ ）和分 ＨＯＭＯ 子体积（Ｖ）与萘、内酯衍生物及其他化合物对细胞色素氧化酶Ｐ４５０１Ａ２抑制剂的两变量线性ＱＳＡＲ模 ｍ ２ 型，结果表明：所选的２个分子结构描述符与５０个抑制剂的活性之间具有很强的线性关系（相关系数ｒ ２ ＝０９０７０）和内部预测能力（留多法交叉验证相关系数ｑ＝０７５１７）。同时，将５０个化合物分成奇数集 和偶数集各自进行筛选建模，并彼此进行外部预测，对全部样本集、奇数集和偶数集样本模型进行了ｙ Ｒａｎｄｏｍｉｚａｔｉｏｎ检验，结果表明描述符Ｅ 和Ｖ建立的模型均非常稳定并具有很高的预测能力。 ＨＯＭＯ ｍ 关键词：细胞色素Ｐ４５０１Ａ２；抑制剂；定量结构－活性相关；密度泛函理论 （ＤＦＴ）；ＶＳＭＰ 中图分类号：Ｒ９１　　　　　　　　　　　　　　　文献标志码：Ａ 种［２］。其中 ＣＹＰ１Ａ１广泛分布于肺、脑、皮肤、 ０　引　言 淋巴细胞等肝外组织，参与烃类致癌物的代谢。 细胞色素Ｐ４５０（ＣＹＰ４５０）是一种含正铁血红 而ＣＹＰ１Ａ２只在肝脏中高水平表达，约占肝脏体 素ＩＸ和半胱氨酸的特殊血红蛋白，因其被还原后 内Ｐ４５０成分的 １３％，其含量仅次于 ＣＹＰ３Ａ和 与ＣＯ可在４５０ｎｍ光谱处出现最大的吸收峰而得 ＣＹＰ２Ｃ两大亚族而位居第３名，并且在不同的个 ［１］ 名 。它是广泛分布于动物、植物、微生物等不 体中，ＣＹＰ１Ａ２在肝脏体内的含量及其活性各有差 ［３］ 同生物体内的一类代谢酶系。Ｐ４５０种类的多样性 异，有的甚至可高达 ６０倍以上 。它们关系密 及其底物的重叠性使Ｐ４５０酶系可以催化多种类型 切，据推测 ＣＹＰ１Ａ２是由陆生动物通过 ＣＹＰ１Ａ１ ［４］ 的反应，不仅对许多外来物质如杀虫剂及其他环 的复制进化而来的 。 境有毒物质具有代谢作用，还参与一些具重要生 目前已发现越来越多的药物经 ＣＹＰ１Ａ２催化 理功能的内源性物质如激素、脂肪酸等的代谢， 代谢，如芳胺、杂环胺以及一些含卤烃化物都是 ［５］ 在生物体中起十分重要的作用，是自然界生物酶 Ｃ