氨基酸-生物化学与分子生物学.PPT

生物化学 研究内容 一、生物分子的结构与功能：探讨生物体的物质组成以及分子结构、性质和功能 二、物质代谢及其调节：物质代谢的规律、能量转化及其调节控制 ……属静态生化 三、基因信息传递规律及其调控：DNA复制、RNA转录、蛋白质翻译、基因表达调控等 通常将生物大分子结构、功能及其代谢调控的研究称为分子生物学（生物大分子的来龙去脉） …… 属动态生化 氨基酸的种类 1809年发现Asp，1938年发Thr，目前已发现180（《生物化学》第三版 王镜岩）/300多种 构成蛋白质的20种氨基酸的结构特点： 1.均为L-α氨基酸，各种aa的R侧链各不相同 2.α-碳原子上均连有一个氨基(脯氨酸除外) 3.α-碳原子为手性碳原子(甘氨酸除外） 近年来发现，谷胱甘肽过氧化物酶中存在由终止密码UGA编码的硒代半胱氨酸，可能是第21种蛋白质氨基酸；目前，第22种氨基酸吡咯赖氨酸 （一）氨基酸的分类 肽 peptide 氨基酸在形成肽链时失去了一分子水，肽链中的氨基酸分子不再完整，称为氨基酸残基(amino acid residue) 由下丘脑分泌，其功能是促进腺垂体释放促甲状腺素(调节糖代谢) 一、蛋白质的一级结构 蛋白质一级结构的概念： 蛋白质分子中所有氨基酸的排列顺序， 主要化学键：肽健，二硫键 氨基酸序列书写： 以氨基端开始,羧基末端结束 依次编1、2、3……… 二、蛋白质二级结构 概念： 是指蛋白质分子中一段多肽链的局部空间结构，即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置，并不涉及到aa侧链R基团的构象 肽键的特点： 肽键的特点 蛋白质的二级结构类型 （二）β－折叠(β－pleated sheet) 2. β－折叠结构特点 （三）β－转角(β－turn) 三 蛋白质的三级结构 蛋白质多肽链中氨基酸残基的排列顺序称为蛋白质的一级结构 Cys Met Phe Lys Ser Thr Val NH2 COOH 胰岛素的一级结构 蛋白质的根本差异在于一级结构的不同 肽键中，与Ｃ-Ｎ相连的O和H呈反式构型 （反式） （顺式） C N O H C N O H C-N单键为0.149nm C=N双键为0.127nm 具有部分双键性质 不能自由旋转 肽键中Ｃ－Ｎ键长为0.132nm C N O H 肽键中的Ｃ＝Ｏ和Ｃ-Ｎ均不能自由旋转和肽键(-CONH-)中的４个原子２个α碳原子( Cα)被约束在一个刚性平面（即肽键平面）上，构成一个肽单元(peptide unit) α－螺旋结构 β－折叠结构 β-转角 无规卷曲 （一）α－螺旋 (α－helix) 由肽键平面盘旋形成的螺旋状构象 2.α－螺旋的结构特征 以肽键平面为单位,以α－碳原子为转折盘旋形成右手螺旋 (2) 每3.6个氨基酸残基 绕成一个螺圈(3600) 螺距为0.54nm 每个氨基酸上升0.15nm 肽键平面与中心轴平行 (3)主链原子构成螺旋的主体,侧链在其外部 (4)肽键的CO和NH 都形成氢键 是稳定螺旋的主要作用力 氢键的方向与中心轴大致平行, 肽键平面呈伸展的锯齿状排列,形成的结构称β－折叠。常为两条或两条以上伸展的多肽链侧向聚集在一起形成扇面状，故又称β－折叠片或β－片层 1.概念 相邻肽键平面的夹角为1100 ，呈锯齿状排列;侧链Ｒ基团交错地分布在片层平面的两侧 (３)由氢键维持稳定。其方向与折叠的长轴 接近垂直 (２)２～５条肽段平行排列构成，肽段之间 可顺向平行(均从N-C)，也可反向平行 肽链出现1800回折的转角处结构称为β－转角 1.概念 2.结构特征 *第一个残基的C=O与第四个 残基的N-H形成氢键 *常见于球状蛋白质分子表面 * 绪 论 什么是生物化学？ 就是研究生命化学的科学，它运用化学原理和方法从分子水平探讨生命现象的本质 研究方法： 主要采用化学的原理和方法，同时也与生理学、细胞学、遗传学相联系和交叉 第一节 蛋白质的化学组成 第二节 蛋白质分子结构 第三节 蛋白质结构与功能的关系 第四节 蛋白质的理化性质 第一章 蛋白质结构与功能 碳(C) 50%-55% 氢(H) 6%-8% 氧(O) 19%-24% 氮(N) 13%-19% ~16%；N(g)×6.25 = 样品Pro含量 硫(S) 0%-4% 少量的 P、Fe、Cu、Zn、I…… 第一节 蛋白质的化学组成 元素组成 一、氨基酸(amino acid) 蛋白质的构件分子（building blocks） H N 3 + H Amino group Carboxylic group 氨基酸结构通