水稻条纹病毒基因组组分4的克隆与序列分析论文.pdfVIP

生物技术 水稻条纹病毒基因组组分4的克隆与序列分析} 董志1郭逍宇2张飞云1 1．首都师范大学生命科学学院，北京，100037；2．首都师范大学资源环境与旅游学院，北京，100037 摘要对我国水稻条纹病毒(rice stripe 进行克隆及测序，结果表明RNA4全长为2157 bp．同时在GenBank中搜索到20个已经公布 的RNA4全长，序列同源性比较发现，在核苷酸水平上，Ⅳ分离物与其他分离物的SP同源性 同源性在97．2％一99．4％，NSvc在97．2％～99．3％。通过21个分离物的RNA4IR区段序列 分析结果表明，m有I型654 RNA bp、II型634bp和III型731—738bp三种类型．21个RSV 4IR序列同源率在80．9％一99．2％之间．在21个分离物中，I型、Ⅱ型和m型所占比率分别 为28．6％、9．5％和61．9％．IR序列内部具有一个重要的结构特征，就是具有插入序列，相对 Ⅱ型分离物而言，I型分离物都有一段17nt的插入序列，这段序列比较保守．III型在这段区 域内的插入序列长达101nt，这段插入序列也有不同程度的变异．变异幅度很大从76．2％一 100％之间。 关键词植物学；水稻条纹病毒；RT-PCR；序列分析 and ofRNA4of CloningSequenceAnalysis JY IsolateofRice Virus Stripe ZhilGuo Dong Xiaoyu2ZhangFeiyunl Life ofResourcesEnvironmentand of Normal Tourism， 1．CollegeScience，CapitalUniversity，Beijing100037，China；2．College Normal Capital University，Beijing100037，China RNA4 anisolateofRice from of Abstract of virus．isolated segment stripe JiangyancityJiangsu and asJY and of吖isolated isolate，was sequenced．融姚4 provincedesignated amplified，cloned had in found20RNA4 ofRice virusfromother 2157nucleofide length．We segments stripe wit