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2017-09-03 发布于天津
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dna序列编码的研究进展

生物技术通报年第期 ·综述与专论· BIOTECHNOLOGY BULLETIN 2006 4 DNA序列编码的研究进展 , 12 1 1 崔光照牛云云张勋才 1 2 (郑州轻工业学院电气信息工程学院,郑州 450002; 华中科技大学控制科学与工程系,武汉 430074) 摘要: DNA计算的可靠性和精确度与编码设计的优劣密切相关。随着DNA计算的发展以及DNA计算研究的进一步深入,对编码的要求也越来越高。围绕如何保证理想的生化反应和解的成功提取问题,人们提出了各种各样的约束条件和评价模型,本文简述了DNA编码的原理,综述了当前DNA序列编码的方法,最后分析了DNA编码设计中存在的问题, 并对编码设计的未来发展进行了展望。关键词: DNA计算编码设计汉明距离解链温度自由能 ProgressintheResearchofDNACodewordDesign 1,2 1 1 CuiGuangzhao NinYunyun ZhangXuncai 1 (CollegeofElectricalInformationEngineering,ZZULI,Zhengzhou450002; 2 DepartmentofControlScienceandEngineering,HUST,Wuhan4300074) Abstract:ThequalityofthecodewordisveryimportanttothereliabilityandtheprecisionofDNAcomputing. Also,designingagoodsequence-setisacrucialsteptomanyotherapplications.Wesurveytheusefulconstraintsand severalmodelsforthedesignofDNAsequences,andgivetheevaluationoftheireffects.Finally,wealsopointoutthe problemsandresearchdirectionsaboutencoding. Keywords:DNAcomputing Codeworddesign Hammingdistance Meltingtemperature Freeenergy 1 引言序列的设计方法理论上可以分为阳性设计和阴性用分子技术解决了个顶点的设计。阳性设计方法要求最优化亲和性,使匹配序 Adleman DNA 7 列充分杂交。包括值约束, 含量约束,能量最有向哈密尔顿路问题,开创了DNA计算的新纪元。 T GC m 但后来的研究人员用相同的方法重复此实验,结果