网络时代的生命科学和生物信息技术罗静初 - abc - 北京大学.pdf

21 世纪 100 个交叉科学难题 网络时代的生命科学和生物信息技术 网络时代的生命科学和生物信息技术 罗静初 众所周知，20 世纪90 年代诞生的国际互连网，以及随之而来的信息高速公路计划，意 味着信息时代的到来。21 世纪是生命科学的世纪。信息技术和生物技术，将成为未来经济 发展的支柱。集这两大技术于一身的生物信息技术，是当前技术革命的热点；正在逐渐形成 的生物信息学，是一门崭新的交叉学科。 1999 年4 月，国家自然科学基金委员会在北京九华山庄举办了首届 “21 世纪核心科学 论坛”，议题为 “生命科学中的信息科学”。全国各高等院校和科研机构的41 位专家参加了 这次会议，他们分别来自生物、医学、环境、数学、物理、化学、信息、计算机等各个领域， 其中包括 14 位院士。与会者 “百花齐放” ，各抒己见，对物质、能量、信息三者之间关系展 开了热烈讨论。尽管 “百家争鸣”，众说纷纭，对于 “信息与物质、能量同为现实世界中三 大基本要素”这一提法，似乎为大多数人接受。的确，在知识经济已经开始占主导地位的 21 世纪，以文字、声音、图形、图像、动画为载体的各种信息在政治决策、经济发展、国 家安全、科学研究、教育事业乃至平民百姓的日常生活中正起着越来越大的作用。无论是信 息的传输方式、传输速度，或者是信息利用所产生的效果，与 “烽火狼烟”、“鸿毛传书”的 年代，已经不可同日而语。信息有其固有的属性，既不同于物质，也不同于能量，但却与物 质、能量一样，也是一种资源。从某种意义上讲，信息是一种取之不尽、用之不竭的重要资 源。用得恰当，可以产生比物资、能量大得多的经济、社会效益。充分利用信息资源，不仅 是经济发展的必然需要，也是科学研究的必要手段。计算机是现代化信息储存的主要载体， 计算机网络是现代化信息传播的主要介质。2001 年4 月，新世纪伊始，“网络时代的生命科 学和生物技术”学术讨论会在北京召开，标志着计算机网络在我国生命科学研究和生物技术 开发中的应用开始普及。几乎同时召开的“首届中国生物信息学大会”，是对我国生物信息 学和生物信息技术研究开发队伍的检阅。 90 年代以来，生物信息技术飞速发展，主要得益于基因组计划的实施。几乎与国际互 联网同时诞生的人类基因组计划，是迄今为止耗资最为巨大、竞争最为激烈、意义最为深远 的大型国际合作研究项目。与人类基因组计划同时起步的模式生物基因组计划，包括小鼠、 果蝇、线虫、拟南芥、酵母等，以及由此引发的其它一系列物种基因组测序，如水稻、玉米 等农作物基因组，猪、牛、羊、鸡等畜禽基因组，河豚鱼、斑马鱼等鱼类基因组，有的已经 完成，有的正在加速进行。据“基因组在线数据库”[GOLD] 2003 年3 月公布的数据，已经 基本完成基因组测序的物种有 132 个，正在进行的有579 个。“基因组计划进展跟踪”网站 [GenomesMOT] 2002 年3 月公布的数据表明，16 种古细菌、99 种真细菌、112 种嗜菌体、 308 种细胞器、280 种质粒、40 种类病毒、873 种病毒的基因组序列测定已经完成。已完成 的细菌和病毒基因组中包括脑炎、肺炎、流感、结核、梅毒、爱兹病等流行病的病原菌或病 毒。 人类基因组计划的实施，使我们对于人类自身的研究，进入了一个新阶段。在探索遥远 的月球、火星、太阳系乃至整个宇宙奥秘的同时，在掌握了能够毁灭人类自身几百次的核技 术以后，人类必须冷静地、认真地考虑涉及自身生存最基本最普遍的问题：健康和环境。据 全球最大的基因组测序和生物信息技术企业Celera 公司称，世界上每分钟有10 个儿童死于 营养不良；每小时有11 个美国人死于用药不当；艾滋病毒每天在一个病人身上扩增一亿倍。 -1- 21 世纪 100 个交叉科学难题 网络时代的生命科学和生物信息技术 我们知道，脱氧核糖核酸DNA 和蛋白质是两种主要的生物大分子，前者是遗传密码的 携带者，是信息的载体。后者是功能单位，是一切生命活动的基础。完成人类基因组30 亿 个碱基对的全序列测定，只是人类基因组计划的第一步。搞清楚人类基因组全套遗传密码的 含义，则是人类基因组计划的最终目标。由此引发的结构基因组、功能基因组、药物基因组、 转录组、蛋白组