flexcontrol 使用指南flexcontrol flexcontrol 质谱数据采集流程.ppt

Bruker Confidential 质谱数据采集流程 1. 启动软件，进入登录界面 1. 软件界面：常用的功能按钮 2. 方法选择：进入采集方法选择界面仪器的所有参数都保存在相应的采集方法中，只要根据实验需要选择相应的方法，适当调整少数几个参数即可 显示菜单Display：显示峰信息 5. 自动采集：设定是否移动式打靶移动打靶可增加采样点数，PAC靶应移动打靶,蛋白样品一般不移动打靶。 6. 靶位校正：靶位的自动校正在AnchorChip靶和PAC进靶过程中，仪器会自动进行靶位的校正 如果不能进行自动校正或靶位有偏差，可手动进行靶位的校正:在靶的任意三个角上各选一个靶点进行定位。 1) 先选定第一点，点击按钮Go 2) 在靶点中心，点击鼠标左键，使之与红圈中心对准。 3) 点击按钮Reached 4) 选定第二点,点击按钮Go,…… 5) 重复第一点校正的步骤,点击按钮Reached, 依次完成其余两点的校正。 7. 质谱仪参数的设置： 离子源和反射器的电压，基质峰抑制 根据样品信息和测量要求，设定扫描范围。如果信号很弱，可适当调高检测器增益。 8. 选择/编辑质谱图标峰方法（1） 8. 选择/编辑质谱图标峰方法（3） 8. 选择/编辑质谱图标峰方法（4） 8. 选择/编辑质谱图标峰方法（5） 8. 选择/编辑质谱图标峰方法（6） 10. 仪器的质量校准 如果质量校准文件列表中没有匹配的文件,可以自行编辑,但要知道各个标准品的准确分子量。 第二步：采集并累加到合适的谱图后，点击 Automatic Assign按钮，进行自动标峰校.准 第三步：点击 Apply 按钮。如果误差值较大，应重复校准，直到满足要求。 如果较长时间没有校准仪器，质量偏差过大，不能自动指认校准峰，应进行手动指认。先选中一个标准品。 第四步：选中一个标准品后，再在相应质谱峰的左下边点击一下鼠标左键 第五步：依次完成各个标准品峰的指认后，点击 Apply。如果误差值较大，应重复校准，直到满足要求；如果个别峰的信号不好或误差值较大，可点击右键放弃该峰 显示质量校准参数 显示仪器状态参数：如果屏幕右下角的状态栏显示红色或仪器的错误信息，可查看仪器的状态参数。 11. 仪器状态详细参数—— 真空系统 11. 仪器状态详细参数—— 样品靶 11. 仪器状态详细参数—— 计算机配置 保存和发送仪器状态报告 根据校准所用的标准品,选择质量校准文件 第一步：选择质量校准文件 编辑质量校准文件 10. 仪器的质量校准 10. 仪器的质量校准 10. 仪器的质量校准 10. 仪器的质量校准 10. 仪器的质量校准 10. 仪器的质量校准 10. 仪器的质量校准 显示仪器状态参数 显示更多仪器状态参数 11. 仪器状态详细参数 如果数据大于80%，则需要清洗离子源 11. 仪器状态详细参数—— 处理器 11. 仪器状态详细参数—— 电压 11. 仪器状态详细参数—— 激光系统 11. 仪器状态详细参数——数据采集器 检查真空度是否正常 Bruker Confidential flexControl 使用指南 flexControl flexControl 选取适当的数据采集方法 根据图谱质量，改变激光能量等参数，获取质量更佳的质谱图 保存质谱数据 主要内容 1. 软件启动与软件界面 2. 方法选择、调用与保存 3. 显示菜单Display 4. 选择靶板类型 5. 自动采集设置 6. 靶位校正 7. 质谱参数设置 8. 选择/编辑质谱图标峰方法 9. 仪器高级参数设置 10. 仪器质量校正 11. 仪器状态详细参数 工具栏 下拉菜单 图谱区 样品靶 1. 软件界面 激光能量调整标尺 样品 当前采集数据 当前累加数据 平滑数据 减基线 保存方法 保存谱图 关闭摄像灯 显示峰信息 标峰 当前激光照射次数 200次激光照射后自动停止 已累加激光脉冲次数 激光脉冲频率 清除内存谱图 保存谱图 1. 软件界面：手动采集时常用的按钮: Start→Add→Save As→Clear Sum 开始采集 添加谱图到内存 L: 线性模式；R: 反射模式 P: 正离子模式；N: 负离子模式 PepMix: 适合多肽混合物 (m/z 700-4000 Da) ProtMix: 适合蛋白混合物 (m/z 5000 – 20000 Da) ClinProt: 适合多肽/蛋白混合物 (m/z 1000 – 20000 Da) 66kDa: 适合大分子量蛋白 (m/z 20000-100000 Da) Proteomics_HPC: 高精度校正，适合蛋白质鉴定(m/z 700-4000 Da) par: 一级质谱