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分子马达运动机制的动力学研究毕业论文
分子马达运动机制的动力学研究
摘要
生物体内的一切活动,从肌肉收缩、细胞内部的运输、遗传物质
(DNA)的复制、一直到细胞的分裂等等,追踪到分子水平,都是具有马
达功能的分子马达做功推动的结果。分子马达是可以高效率地将化学能
直接转化为机械能的一类蛋白质。当分子马达的运用协调起来就产生了
宏观的定向运动而做功,其中蕴含的动力学机制已成为众多研究者们关
注的焦点。本文首先对分子马达的研究作了简单介绍,包括分子马达的
种类、驱动蛋白和ATP合酶的生物化学研究进展以及分子马达的生物
物理研究进展。
本文对驱动蛋白的定向运动进行了理论分析,提出驱动蛋白产生定
向运动的三个必要条件,并对驱动蛋白这些条件的形成作了深入分析。
在分析的过程中,本文提出了两个全新的基本观点,为驱动蛋白的定向
运动提供了一种可能的解释。
因分子马达处于胞质液体的环境中,物理学上将其看成是布朗棘
析和计算。本文对处于不同环境下的分子马达系统,采用计算机模拟和
Mome
些系统下定向运动的能力,得出:无外部驱动力时,仅在白噪声的作用
下不能驱动分子马达作定向运动;当系统存在恒定外力或正弦形式的周
期外力,在白噪声作用下分子马达沿微管作定向运动,只是在正弦外力
下马达的定向运动能力比相应条件恒定外力下的要弱很多;无外部驱动
东oF人中硕十研究卫中也论文 分子屿返运础机制的础山中研究
力时,色噪声在非对称周期势下能驱动分子马达作定向运动,而在对称
周期势下不能。
本文还对分子马达在定向运动过程中的停留时间作了深入研究。根
据前面对不同系统下马达定向运动能力的对比分析,我们选取在色噪声
和恒定外力共同作用下的分子马达系统,建立相应的Langevin方程。应
用MonteCarlo方法计算分析了色噪声关联时间、噪声强度及外部作用
力与停留时间的关系,并与同条件下这些参数和跃迁时间JT的关系作
比较分析,分别对产生这些结果的内在原因进行分析,对这些结果作出
可能的解释。
进一步考虑到驱动蛋白的双头结构,本文引入双头耦合作用势函
数,建立了在色噪声和恒定外部驱动力共同作用下的双头耦合模型。通
Carlo模拟方法,我们计算分析了双头耦合作用势的耦合系数和阱深参
数对分子马达两头间运动及马达整体定向运动的影响。计算结果表明:
(1)耦合系数能决定耦合作用势将马达束缚在势阱中的能力,耦合系
数越大,耦合作用势对马达运动的制约越强,定向运动能力越弱; (2)
阱深参数既决定束缚马达于势阱中的能力,又决定对两头间运动的牵制
作用。阱深参数越大,耦合作用势将马达束缚在势阱中的能力越强,同
时对两头间距离的牵制作用减弱,这两个完全相反的作用效果互相竞
争,由它们决定着马达定向运动能力的增强或减弱。
关键词:分子马达,定向运动,停留时间,双头耦合模型,非平衡涨落
东oF人中硕十研究,上中位论文 分子屿返运讪机制的础JJf研究
DYNAMICALSTUDYMOLECULARMOTOR’S
ON
MOTIONMECHANISM
ABSTRACT
Inthe ofmolecularmotorsoutvarious
cells,hundreds carry
organism
functionsinthe ofcontractionof
process muscles,cellular
SO areakindof
DNA andon,Thesemotors enzyme
duplication,mitosis
thatCall convertchemicalintomechanical
proteins efficiently
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