核酸化学概论(谢圣高)1汇编
原核生物启动子结构特点: 一致性序列(concensus保守序列): 碱基序列相对稳定,不易发生突变。 TTGACA:-35区,RNA聚合酶的辨认位点,结合疏松,是σ亚基结合位点。 TATAAT:-10区,Pribrow盒,RNA聚合酶的稳定结合位点。β亚基的结合位点。 TATA盒 CAAT盒 GC盒 增强子 顺式作用元件 结构基因 -GCGC---CAAT---TATA 转录起始 真核生物启动子保守序列 四、 终止因子(termination factor) ρ因子(rho factor) ----协助RNA聚合酶辨认终止区并终止转录 转录过程 The Process of Transcription 第二节 原核生物的转录过程 (一)转录起始 转录起始需解决三个问题: RNA聚合酶必须准确地结合在转录模板的起始区域。 DNA双链解开,使其中的一条链作为转录的模板。 转录起始复合物形成。 辨认起始位点: ?亚基辨认启动子的-35区,RNA聚合酶全酶 (?2????)与模板疏松结合。 酶滑行到-10区,通过??亚基与模板牢固结合。 2. DNA双链解开: RNA聚合酶挤入DNA双链中,解链长度约20个核 苷酸, 拓扑异构酶参与。 转录起始过程: 3. 在RNA聚合酶作用下发生第一次聚合反应,形成转录起始复合物。 RNApol (?2????) - DNA - 5pppGpN- OH 3? 转录起始复合物: RNA聚合酶-DNA模板-四磷酸二核苷酸 5?-pppG -OH + NTP ? 5?-pppGpN - OH 3? + ppi (二)转录延长 1. ?亚基脱落,RNA–pol聚合酶核心酶变构,与模板结合松弛,沿着DNA模板前移; 2. 在核心酶作用下,NTP不断聚合,RNA链不断延长。 (NMP) n + NTP ?? (NMP) n+1 + PPi 3. 转录空泡的形成: 目 录 DNA/DNA双链比DNA/RNA杂化双链稳定 稳定性: G≡CA=TA=U DNA双链超螺旋作用 5? 3? DNA 原核生物转录过程中的羽毛状现象:边转录边翻译 核糖体 RNA RNA聚合酶 依赖Rho (ρ)因子的转录终止 非依赖Rho因子的转录终止 (三)转录终止 RNA聚合酶在DNA模板上停止前进,转录产物RNA链从转录复合物上脱落。 机制 A T P 依赖 Rho因子的转录终止: 具有控制转录终止作用的蛋白质因子。 机制: Rho因子与RNA3’-OH的poly C结合, 抑制聚合酶活性,激活解螺旋活性。 2. 非依赖 Rho因子的转录终止 DNA模板近终止处,有特殊的碱基序列,转录出RNA产物形成特殊的结构终止转录。 发夹或茎环结构:局部二级结构 末端PolyU:U:A不稳定. 5`UUGCAGCCUGACAAAUCAGGCUGAUGGCUGGUGACUUUUUAGUCACCAGCCUUUUU... 3` 5`UUGCAGCCUGACAAAUCAGGCUGAUGGCUGGUGACUUUUUAGUCACCAGCCUUUUU... 3` RNA 5?TTGCAGCCTGACAAATCAGGCTGATGGCTGGTGACTTTTTAGTCACCAGCCTTTTT... 3? DNA UUUU...… UUUU...… 5`UUGCAGCCUGACAAAUCAGGCUGAUGGCUGGUGACUUUUUAGUCACCAGCCUUUUU... 3` 茎环(stem-loop)/发夹(hairpin)结构 真核生物的转录后修饰 Post-transcriptional Modification 第三节 几种主要的修饰方式 1. 剪接(splicing) 2. 剪切(cleavage) 3. 修饰(modification) 4. 添加(addition) 一、真核生物mRNA的转录后加工 (一)首、尾的修饰 5?端形成 帽子结构 (m7GpppGp —) 3?端加上多聚腺苷酸尾巴 (poly A tail) 鸡卵清蛋白成熟mRNA与DNA杂交电镜图 DNA mRNA 目 录 (二)mRNA的剪接 2.外显子(exon)和内含子(intron) 外显子:(基因上的编码序列) 在断裂基因及其初级转录产物上出现,并表达为成熟RNA的核酸序列。 内含子:(基因上的非编码序列) 在断裂基因及其初级转录产物上出现,而在剪接过程中被除去的核酸序列。 鸡卵清蛋白基因 hnRNA 首、尾修饰 hn
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