中药化学成分与cyp2c19相互作用预测研究 - 中国现代中药.pdf

２０１５年５月　第１７卷　第５期 中国现代中药　ＭｏｄｅｒｎＣｈｉｎｅｓｅＭｅｄｉｃｉｎｅ Ｍａｙ２０１５　Ｖｏｌ１７　Ｎｏ５ ·基础研究 · 中药化学成分与ＣＹＰ２Ｃ１９相互作用预测研究△ ———基于定量构效关系（ＱＳＡＲ）模型 １ ２ １ ２ １ １ ２ 雷蕾 ，王新洲 ，张黎 ，朱永亮 ，杨策 ，崔蒙 ，钱向平 （１中国中医科学院中医药信息研究所，北京　１００７００；２苏州润新生物科技有限公司，江苏　苏州　２１５１２３） ［摘要］　目的：使用随机森林（ＲＦ）算法和支持向量机（ＳＶＭ）算法构建定量构效关系模型（ＱＳＡＲ），并筛选出最 优模型，对部分有毒中药包含的化学成分对 ＣＹＰ２Ｃ１９可能的作用进行了预测，为临床应用和药物开发提供参考。 方法：本文使用Ｍｏｌｄ２软件（ｖｅｒｓｉｏｎ２００）对收集到的１３０个化学成分进行分子描述符计算，对其进行初步筛选后， 分别采用ＲＦ和ＳＶＭ进行预测模型的构建，最后筛选出最优预测模型，并对中药化学成分进行预测。结果：根据预 测模型的准确度和接收器操作特征（ＲＯＣ）值筛选出最优分子描述符为６个，合并ＳＶＭ和Ｌｅａｖｅ１０％ｏｕｔ交叉验证方 法模型为最优预测模型。对 《中华人民共和国药典》２０１０版１０个大毒中药，例如斑蝥、马钱子、天仙子等包含的 化学成分进行了预测，得到一些有意义的结果。结论：定量构效关系模型（ＱＳＡＲ）对中药化学成分进行预测研究可 以为联合用药和进一步研究提供参考。 ［关键词］　定量构效关系模型；ＣＹＰ２Ｃ１９；中药化学成分 ＰｒｅｄｉｃｔｉｏｎｏｆＩｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｂｅｔｗｅｅｎＣｈｅｍｉｃａｌＣｏｍｐｏｎｅｎｔｏｆＣｈｉｎｅｓｅＨｅｒｂｓａｎｄＣＹＰ２Ｃ１９ｗｉｔｈＱＳＡＲ １ ２ １ ２ １ １ ２ ＬＥＩｌｅｉ，ＷＡＮＧＸｉｎｚｈｏｕ，ＺＨＡＮＧＬｉ，ＺＨＵＹｏｎｇｌｉａｎｇ，ＹＡＮＧＣｅ，ＣＵＩＭｅｎｇ ，ＱＩＡＮＸｉａｎｇｐｉｎｇ （１ＩｎｓｔｉｔｕｔｅｏｆＢａｓｉｃＲｅｓｅａｒｃｈｉｎＣｌｉｎｉｃａｌＭｅｄｉｃｉｎｅ，ＣｈｉｎａＡｃａｄｅｍｙｏｆＣｈｉｎｅｓｅＭｅｄｉｃａｌＳｃｉｅｎｃｅ，Ｂｅｉｊｉｎｇ１００７００，Ｃｈｉｎａ； ２ＳｕｚｈｏｕＮｅｕｐｈａｒｍａＣｏＬｔｄＳｕｚｈｏｕ，２１５１２３，Ｃｈｉｎａ） ［Ａｂｓｔｒａｃｔ］　Ｏｂｊｅｃｔｉｖｅ：Ｉｎｏｒｄｅｒｔｏｐｒｏｖｉｄｅｒｅｆｅｒｅｎｃｅｆｏｒｃｌｉｎｉｃａｌａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎａｎｄｄｒｕｇｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ，ａｑｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅａｃｔｉｖｉｔｙｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐ（ＱＳＡＲ）ｍｏｄｅｌｗａｓｂｕｉｌｄｕＰｕｓｉｎｇＲａｎｄｏｍＦｏｒｅｓｔ（ＲＦ）ａｎｄＳｕｐｐｏｒｔＶｅｃｔｏｒＭａｃｈｉｎｅ（ＳＶＭ）ａｎｄ ｐｒｅｄｉｃｔｅｄｃｈｅｍｉｃａｌｃｏｍｐｏｎｅｎｔｓｏｆｓｏｍｅｔｏｘｉｃＣｈｉｎｅｓｅｈｅｒｂｓｗｉｔｈｔｈｅｂｅｓｔＱＳＡＲｍｏｄｅｌＭｅｔｈｏｄｓ：Ｆｉｒｓｔ，Ｍｏｌｄ２ｓｏｆｔｗａｒｅ （ｖｅｒｓｉｏｎ２００）ｗａｓｕｓｅｄｔｏｃａｌｃｕｌａｔｅｍｏｌｅｃｕｌａｒｄｅｓｃｒｉｐｔｏｒｓｏｆ１３０ｃｈｅｍｉｃａｌｃｏｍｐｏｎｅｎｔｓＡｆｔｅｒｐｒｅｌｉｍｉｎａｒｙｓｃｒｅｅｎｉｎｇｏｆ ｍｏｌｅｃｕｌａｒｄｅｓｃｒｉｐｔｏｒｓ，ＱＳＡＲｍｏｄｅｌｓｗｅｒｅｂｕｉｌｔｕＰｗｉｔｈＲＦａｎｄＳＶＭＴｈｅｎｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｏｆｃｈｅｍｉｃａｌｃｏｍｐｏｎｅｎｔｓａｎｄＣＹＰ２Ｃ１９ ｗａｓｐｒｅｄｉｃｔｅｄｂｙｔｈｅＱＳＡＲｍｏｄｅｌｗｉｔｈｔｈｅｂｅｓｔａｃｃｕｒａｃｙａｎｄＲＯＣＲｅｓｕｌｔｓ：ＴｈｅｏｐｔｉｍａｌＱＳＡＲｍｏｄｅｌｏｆｓｉｘｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｄｅｓｃｒｉｐｔｏｒｓ，ＳＶＭａｎｄＬｅａｖｅ１０％ｏｕｔｃｒｏｓｓｖａｌｉｄａｔｉｏｎｗａｓｄｅｔｅｒｍｉｎｅｄｂａｓ