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孵育时间在二氧化钛选择性富集磷酸化肽中的影响
中国生物工程杂志 ChinaBiotechnology,2012,32(3):5962
孵育时间在二氧化钛选择性富集磷酸化肽中的影响
詹 胜 银兴峰 李 慧 李 楠 阳小燕 孙雪松
(暨南大学生命与健康工程研究院 广州 510632)
摘要 目的:旨在探索孵育时间在二氧化钛选择性富集磷酸化肽中的影响。方法:以大肠杆菌
BL21(DE3)为材料,预实验确定二氧化钛磁珠与肽段之间的最适比例,之后在此比例下继续探究
不同孵育时间条件下的富集效果,以观察孵育时间在二氧化钛富集体系中的影响。结果:预实验
确定磁珠与肽段之间最适比例为3∶1,在此比例下发现随着孵育时间的增加其富集效率会逐渐降
低,最后确定大肠杆菌中最适孵育时间为5min。结论:孵育时间在大肠杆菌二氧化钛富集体系中
对富集效果有明显的影响,并且呈负相关。推测不同样品的最佳孵育时间与样品种属有关。
关键词 二氧化钛 磷酸化 孵育时间 大肠杆菌
中图分类号 Q81
磷酸化是蛋白质翻译后修饰的重要共价修饰形 与阳离子结合。磷酸盐、羧酸盐及硫酸盐等都与二氧
式,普遍存在于真核与原核生物之中,是生物界最普遍 化钛具有良好的亲和力,其中磷酸盐亲和力最高。通
的一种蛋白质翻译后修饰,约有 1/3的蛋白质被认为 过添加有机酸2,5二羟基苯甲酸(2,5DHB)和邻苯二
是具有磷酸化修饰现象的。而蛋白质的磷酸化与去磷 [5]
甲酸(PA) 可以有效降低非磷酸肽的结合,但由于其
酸化这一可逆过程更是几乎调节着包括细胞增殖、发 [6]
会造成电喷雾离子源的污染,故目前多采用Wu等 报
育、分化、骨架系统调控、新陈代谢、衰老与凋亡等几乎 道的以谷氨酸作为非特异性吸附抑制剂,这样既避免
[1]
所有的生命活动过程 。相对于真核生物,原核生物 [7]
了污染同时也可得到很好的富集效果。Zeng等 发现
的磷酸化蛋白较少。例如,细菌中主要有三种磷酸化 肽段与二氧化钛珠子的比例对磷酸化富集结果有重要
系统,即组成重要信号传导途径 的双组分系统 影响,且比例与物种有关。本文针对路易斯酸碱反应
[2]
(Cpx) 、磷酸烯醇丙酮酸 -糖磷酸转移酶系统 的另一个影响因素———反应时间,在预先优化得出肽
[3]
(PTS) ,以及曾经被认为只存在于真核生物中的丝氨
段与珠子合适比例的基础之上,继续改变孵育反应的
酸、苏氨酸、酪氨酸的磷酸化系统[4]。
时间,通过观察和比较,发现孵育时间也是影响富集效
由于经过磷酸化修饰的蛋白质含量很少、磷酸化
率的重要因素,大肠杆菌的肽段与珠子孵育的时间并不
蛋白丰度低、质谱检测离子化效率低,复杂生物样品中
像目前报道真核生物常用的20min或者60min那样,而
大量高丰度非磷酸化肽段等原因造成直接检测的低检
是较短的5min较为合适,表明孵育时间与物种有关。
出率,因此样品送检之前进行磷酸化肽段的富集显得
尤为重要。目前应用最广泛的是金属氧化物二氧化钛 1 材料与方法
富集法,具有富集效果好、价格低、操作方便等优点。
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