附录2 用gaussian 98w1作振动频率的密度泛涵计算(dft) 本附录讲述 .pdfVIP

警告: 资料中提及的实验可能潜在危险,必须经过专门的安全培训,使用专门的仪器与设备, 并在适宜的人监督下完成.工具的安全程序和措施的责任,义务,风险全部由你个人承担.麻 省理工学院不对材料中提及的内容或工具承担任何责任,义务或风险。 法律声明 附录 2 用Gaussian 98W1作振动频率的密度泛涵计算(DFT) 本附录讲述了用Gaussian 98W 软件计算乙炔同素取代物振动频率的方法我 们将使用Gaussian 98来进行密度泛涵计算,解乙炔分子的全哈密顿算符方程,并 从计算的势能面得到一般模型的振动频率.并与你的实验结果进行比较。 1. 构建C2H2 Gaussian 98W DFT计算需要一个在笛卡儿坐标中的初始结构式作为输入文 件。结构式可以在高斯界面中交互式地生成,并存储为输入文件。 在高斯界面中,有三个窗口专门设计来帮助你构建输入文件的几何图形: (i) 高斯界面 2.1, (ii)生成器 与(iii) 浏览器1 (见图.1)。 图.1—高斯界面(GaussView)中的初始窗口 从构建器窗口中点击 –R Group键，在它下面是一个较大的子键向导。出现一个 Select -R Group Fragment窗口。选择CH≡C–基团；在 –R Group键的子键中将 出现相同的CH≡C–基团。Group Fragment窗口自动关闭。 图.2. GaussView 中的 Group Fragment 窗口 开始构建乙炔结构式,现在在View窗口中的任何地方点击，乙炔的球棍模型结构出 现了。如果必要按下Center键。 图.3—乙炔的结构 2.计算设置 现在你已经创建好了开始的结构，下面你必须设置计算参数并定义使用的理 论标准。 点击Calculate然后，点击Gaussian (在GaussView 2.1窗口中) 以出现 Gaussian Calculation Setup窗口。在Title窗体中，输入你选择的标记计算的 名字。把Charge设置为0；Spin设置为singlet。在Job Type窗体中选择计算类型 为Opt+Freq。紧随振动频率计算之后将进行几何形状优化。并且确保已选上No Raman Intensities以加速计算。在Method窗体中作如下选择以定义原理准则: Ground state, B3LYP, Restricted，基本设置: 6-311G。在Solvation窗体中, 选 择none。在General Options窗体中, 确保所有的条目都未被选上! 图片 4—计算参数设置窗口 3. 编辑输入文件 建好的分子结构式和设置中的选项被用来生成一个包含计算参数的设置文 件现在你可以编辑这个输入文件来设置所有三个同位素取代物的交互式的计算。 点击 Edit.，编辑输入文件。 点击按钮然后按照说明先保存输入文件输入 文件将随之出现在 Notepad 窗口中. 输入文件中第一排以%开头的是计算变量.