2生物信息数据库.pptVIP

四、其他重要的核酸序列数据库 dbEST：dbEST是GenBank中的一个子数据库，包含来源于不同物种的表达序列数据和表达序列标签序列的其他信息。 ncRNAdb：非编码RNA（non-coding RNA ncRNA）数据库旨在提供非编码RNA的序列和功能信息。 miRBase：miRBase序列数据库主要存放已发表的微小RNA（microRNA miRNA)序列和注释的数据库。 序列数据库 基因组数据库 来源于人类基因组计划及各种模式生物基因组计划 1977年，最早获得的生物基因组全序列是噬菌体(53kb) 1995年，第一个自由生物体流感嗜血菌(H. inf)被完全测序 GDB（美国、加拿大）The Genome Database 1990年，John Hopkins大学建立，后由加拿大儿童医院生物信息中心管理. 数据内容： 基因单位、PCR位点、细胞遗传标记、EST、contig、重复片段、基因组图谱 与其它分子生物信息网络资源（EMBL、GenBank…）的链接 AceDB 线虫基因组数据库。既是一个数据库，又是一个数据库管理系统。 提供很好的图形界面，用户能够从大到整个基因组小到序列的各 个层次观察和分析基因组数据。 数据内容： 限制性图谱，基因结构信息，质粒图谱