m93360027 郑育欣.pptVIP

前言 (1) 冷血動物如蜘蛛、昆蟲等， 是以冬眠度過冬天。 海洋魚類如何生活在大西洋冰水中的。 (2) 抗凍蛋白(antifreeze proteins, AFPs)最早是在極地 的魚類體內所發現，之後在許多生物體內如細菌、真 菌、無脊椎動物及植物等皆純化出類似功用之蛋白 。 (3) 抗凍蛋白的功能有使農作物能抗寒增加收成或控制冷 凍食物裡的冰晶大小，可以增加它們的食用壽命。 實驗方法 1 從黃粉蟲中Clone出TmAFP gene 2 利用細菌產出大量抗凍蛋白並純化他 3 將此抗凍蛋白結晶化 4 作X-ray繞射， 解結構 5 用軟體分析，並作Ramachandran plot Ps 黃粉蟲Tenebrio molitor L. 在昆蟲分類學上隸屬於鞘翅目，擬步行蟲科，粉 甲屬。(一種倉儲害蟲)。 TmAFP structure 側面觀 TmAFP structure TmAFP structure TmAFP structure TmAFP structure TmAFP structure 結論 @ TmAFP會不可逆的binding上冰晶，阻止冰晶變大或形成。 @ TmAFP他具有tandem repeat sequence，會轉譯出特殊有規律的β-helix structure 。 @ 這個protein幾乎沒有hydrophobic core ，但他仍然stable ，因為有許多的disulphide bonds and hydrogen bonds可以穩定結構。 @ 此protein的conserved sequence ~ threonine-cysteine-threonine motifs 會轉譯出 flat β-sheet ，而這個flat β-sheet 就是會binding上ice的結構。 期末方向 @ 原因 : 因為昆蟲的AFP在阻止冰晶生長上比起魚類的AFP還有效100倍。所以我想找有關“ 海水魚”抗凍蛋白的結構和這篇結構加以比較， @ 分析 : 利用swiss pdb viewer軟體去做分析。 @ 目的 : 從結構中是否可以看出為什麼昆蟲的AFP效率較好的可能原因。 * * 結構生物期中報告 Mimicry of ice structure by surface hydroxyls and water of a b-helix antifreeze protein Yih-Cherng Liou, Ante Tocilj, Peter L. Davies Zongchao Jia Department of Biochemistry, Queens University, Kingston, Ontario K7L 3N6,Canada ID:1EZG 鄭育欣 * * *