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第一个测序云计算平台来了！ 新一代测序的瓶颈 自从人类基因组计划以来，测序技术的进步可谓日新月异。过去倾全世界之力也需要耗 时近10 年才能完成的人类基因组测序，如今的新一代测序只需数日即可完成。但是，新一 代测序（NGS）系统的最大挑战之一是需要高性能的计算设施，以支持（庞大的）数据分 析和储存。设想，以100-200bp 的序列读长，要拼接出整个基因组，那需要多么庞大的数 据分析和存储！以华大基因为例，仅仅是数据分析就号称有3000 人的团队。普通实验室哪 里能有这个计算能力！Hold 不住？ 生物学家友好的生物信息学 云计算解决之道 在设计中充分考虑到生物学家的需 Illumina 在高端新一代测序市场上 求，BaseSpace 一键式生物信息学应用 已经占据比较优势的地位，为将新一代 程序可谓简单易用，能从原始数据中产 测序技术普及到普通规模实验室，又推 生生物学相关且可操作的结果。 出小型新一代测序Miseq。深明数据分 BaseSpace 输出文件是行业标准的，采 析是新一代测序技术之瓶颈，清楚地认 用开放的格式，如bam（定位和比对）、 识到普通实验室缺少高性能计算设施支 vcf（变异体检出）、fastq（原始读取） 持庞大的数据分析和储存，Illumina 最新 和text 格式。有了这些文件格式，您能 推出了为生物学家打造的新一代测序云 将BaseSpace 数据轻松导入您喜爱的 计 算 平 台 ——BaseSpace 。 有 了 科学软件工具进行进一步分析。 BaseSpace，实验室就能够省去维护IT 设备带来的费用，从而更专注于研究。 简化的数据分析 一键式的分析工具，简化的数据分 从事新一代测序的实验室通常需要 析，可快速轻松地查看结果，而无需专 一位训练有素的生物信息学家来开展数 门的生物信息学资源。在MiSeq® 控制 据分析。BaseSpace 利用云端软件应用 软件（MCS）中，只需在测序运行开始 程序，可帮助实现自动化的生物信息学 时选择使用BaseSpace 来储存和分析。 分析。BaseSpace 目前拥有6个独立的 MiSeq 仪器将数据从仪器无缝推送到云 数据分析应用程序：重测序、扩增子测 端——BaseSpace，进行自动化的分析 序、16S 宏基因组、de novo 装配（由 和储存，立即与合作者随时随地共享数 Velvet 支持）、小分子RNA 和文库QC。 据，并储存无限的数据。同时可选择保