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大菱鲆抗病相关MHC II B等位基因筛选与分析
11
大菱鲆抗病相关MHCB等位基因筛选与分析
II
大菱鲆抗病相关MHC B等位基因筛选与分析
摘要
目前,由于水产业的高速发展,高密度养殖及环境的恶化使水产鱼类病害频
发。培育抗病品种,已成为促进水产业发展的一大重要课题。大菱鲆作为我国重
II
要的养殖鱼类,这一难题也急需解决。MHCB在先天免疫和后天获得性免疫
II
中起着重要作用,并且已有大量研究证明:lVIHCB不同等位基因与机体对病
II
原菌的抗性或易感性有着密切关系。所以,我们研究了大菱鲆MHCB基因的
多态性,以及不同等位基因与大菱鲆抗病性之间的关系。
1.大菱鲆致病菌的鉴定
我们通过16SrDNA序列分析鉴定了大菱鲆致病菌.迟钝爱德华氏茵。该病原
茵来自于实验室保存菌株,是在大菱鲆疾病暴发时期,从其腹腔内分离获取的单
克隆。利用细菌16SrDNA保守区引物8F和1492R扩增其16SrDNA部分序列,
并进行克隆测序。通过测序共获得1505bp的序列,所测三个转化子各不相同。
ictaluri和Edwardsiellatarda。通过进化树分析可以发现,我们所得到的序列与
Edwardsiella
tarda亲缘关系最近,而与Edwardsiellaictaluri相差较远。并且其中
一条序列16SrDNA.2与Edwardsiellaictaluri和Edwardsiellatarda序列比对时,
其与Edwardsiellatarda有100%的相似度。考虑到细菌16SrDNA多拷贝间的差
异以及测序误差在内,因此,可以将大菱鲆病原菌鉴定为迟钝爱德华氏菌
(Edwardsiellatarda)。
II
2。大菱鲆MHCB多态性及其与大菱鲆抗病力的关系
II
通过对大菱鲆MHCB内含子l和外显子2的序列分析,共发现了4种不同
的内含子l(A、B、C和D型),其不同是由于一19bp重复单元的重复次数不
.同所致。内含子1的3’端含有一个富含CT/GT的区,该区域为重组酶RecA的
措在识别位点,表明在其演化史中可能发生过重组事件。 ’.
通过对43个抗病个体中的224条序列和42个易感个体中的214条序列进行
MHCIIB外显子2分析,共发现了59个不同的等位基因,其中包括35个A型、
1I
大菱鲆抗病相关MHCB等位基因筛选与分析
6个B型、13个C型和5个D型。对其中的25个等位基因进行了抗病群体与易
感群体的分布统计分析,部分等位基因在两个群体中都有分布,部分以较低的频
率仅出现抗病或易感群体中。等位基因Scma—DBBl*04在抗病群体中出现频率为
7%,而在易感群体中出现频率为42.9%,与易感性状相关60=0.ooo);等位基因
Scma-DBB2幸Ol在抗病群体中出现频率为44.2%,而在易感群体中出现频率为
19%,与抗病相关够:o.013)相关。
关键词: 大菱鲆,迟钝爱德华氏菌,多态性,主要组织相容性复合体,抗性,
微重组
n
大菱鲆抗病相关MHCB等位基因筛选与分析
and with
ofMHCIIBallelesassociated
Screeninganalysis
diseaseresistanceinturbot
Abstract
withfast of diseasesoecured
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